明永乐年间，乐家从浙江宁波迁至北京，乐氏第一世乐良才，以铃医为生，走街串巷，行医制药。
第四世传人乐显扬，于康熙年间入太医院，乐显扬集古方、宫廷秘方、民间验方和祖传秘方于一身，创办药室，1699年，康熙为其赐名“同仁堂药室”。“同仁”取自经络“铜人”之音，意为“同修仁德、济世养生”，该名号一直沿用至今。
药室创办三年后，乐显扬第三子——乐凤鸣，于北京前门外大栅栏路南开设了同仁药铺。作为第五代传人，乐风鸣在同仁历史上留下了浓墨重彩的一笔。
他于康熙四十五年（1706年）分门汇集成书， 名为《乐氏世代祖传丸散膏丹下料配方》，该书收载宫廷秘方、古方、家传秘方、历代验方362首。
同时在序言中提出，“ 遵肘后， 辨地产”，“炮制虽繁必不敢省人工，品味虽贵必不敢减物力”的制药规范，这一规则被视为乐氏祖训，在今天仍需严格遵守。
这两句话的意思是指，必须严格辨别药材的产地，制药时虽然工序复杂，但绝不能因此省人工，药材虽然价格贵，也不可减少分量，用今天的话来讲即不偷工减料，制药需具备工匠精神。
这一祖训，为后来乐氏同仁的发展，建立起了严格的选方、用药、配比及工艺规范，代代相传，并培育了乐氏同仁良好的商誉。
乐风鸣打响了“乐氏同仁”名号的第一枪
雍正年间，乐氏同仁丸散膏丹，畅销全国。同时，皇家御赐乐家独办官药，“同仁堂乐家老铺”由此成为独享御药供奉殊荣的民间药铺，且历经八朝188年。
后来的乐氏同仁立足中医本源，不断在制药上下功夫，甚至一度触及保健领域。比如，乐氏第九代乐百龄，配置出了“乌鸡白凤丸”，此药深受慈禧喜爱，她除了用来打赏宫中嫔妃之外，自己亦常年服用，以调理身体，保养青春。
此时，乐氏同仁在业界的声誉亦开始达到巅峰。慈禧钦赐乐氏“御供金腰牌”，这在当时的医药界是独一无二的荣誉，从此，乐家经营的同仁堂老铺跨过太医院直接为宫廷供药，名满天下。
另外，值得一提的是，到了乐氏第十代乐平泉，乐氏同仁开始从朝宇走向庙堂，真正实现了普惠天下，济世苍生的意愿。
在此期间，他们多研发了十多个品种，并广做善事，提供沟灯（类似于路灯）、舍棺材、设粥棚、办义学、送暑药、设水会（民间救火机构），更将国药——安宫牛黄丸普及民间。
乐平泉去世后，乐家的家事铺务均由他的继配夫人许叶芬掌管。1889年由许叶芬署检的《同仁堂药目》再版发行，收录成药、药酒、及药材共495首。乐氏同仁老药铺所挂对联“本堂发兑各省地道生熟药材，本堂诚修诸门应证丸散膏丹”便出自其《序言》。
此后，随着国事动荡，乐氏同仁在历史的洪流中，开始了长达百年的浮沉之旅，这里面，有家族分离，有堂号分派，中华医学的精髓亦得到了传承。
1949年，新中国成立前夕，乐崇辉携部分乐氏同仁老药工，以及祖传的《乐氏民初手抄秘方本》辗转台湾，该秘方本记载了198个乐氏同仁古方，加上其它传承配方，共有431种个乐氏同仁配方。
乐崇辉在台湾安顿下来之后，招收学徒在台北开封街开办台湾乐氏同仁堂药铺，据说，直到他将进90岁高龄时，仍然制药教徒，以让同仁堂的制药古方得以传承。
据说，著名影视剧《大宅门》，即取材于乐家创办阿胶厂历史改编，剧中男主角白景琦的原型为北京乐氏家族第十二世乐敬宇，剧中“ 白” 家的姓氏取自繁体“ 乐” 字中间的“白”。
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