孙中山闹革命，一开始看不上学生，他认为学生爱说空话大话，经不起磨难，所谓“秀才造反，十年不成”，学生们也没有经济来源，不是筹款和发展会员的理想对象。但是，惠州起义后，革命进入低谷，他在美国、欧洲苦苦寻觅革命良策时，却发现了学生大军。
日本与俄国争夺中国东北。俄国提出了独占满洲的要求，日本媒体大肆报道，煽风点火，宣扬日本要“抗俄援清”，留日学生悲愤交加，瞬间点燃了“爱国”热情！1903年留日学生黄兴就成立了“拒俄义勇队”，要以任何形式上阵杀敌，哪知道被清朝政府通知日本政府取缔了。学生们再次愤怒，清廷防范学生甚至超过俄国！学生们已经看过了外面的世界，明白大清落后在于体制，对外处处挨打，对内压制百姓，既然对朝廷绝望了，干脆反了！
在这个背景下，留日学生成立军国民教育会，工作内容分为鼓吹、暗杀、起义三部分，黄兴是暗杀团成员；各省留日学生纷纷成立自己的革命团体，浙江叫光复会，湖北叫科学补习所。当时孙中山的兴中会已经名存实亡，他在这个背景下回到日本。宫崎寅藏极力向黄兴、宋教仁介绍孙中山，称他是罕见的伟人。黄兴明白，他们要成立联盟，必须维护孙中山的领导地位，否则会失去日本人的支持。
为了发展革命成员，扩大孙中山的影响，黄兴、宋教仁组织了一个“留日学生欢迎孙文大会”，他们创办的刊物本来读者就很多，这次大会，来了2000人！孙中山穿一身白西装，发表了两个小时的革命演讲，学生们不时爆发出热烈的掌声。会后，在犬养毅的同乡家里，同盟会成立了！
同盟会是兴中会、华兴会、光复会等组织的联盟，在同盟会的旗帜下，这些组织还各自行动，各有各的筹款渠道，各有各的工作部署。但是在这些“山头”之上，需要一个号召人，作为精神领袖。同盟会分为执行部、议事部和司法部三个部门，分别对应西方国家的政府部门（内阁）、立法部门（议会）和司法部门，参照了：三权分立原则。
执行部的总理，就是西方国家的“内阁总理”，由全员选举产生，四年一届，总理只能向议事部提议案，获得批准之后再去执行；反过来，议事部也可以弹劾总理。司法部也是独立的。
孙中山成立执行部总理，并不是选出来的，当时黄兴认为，凭着他和华兴会的影响力，一旦进入选举程序，孙中山可能选不上，但日本人支持孙中山，同盟会可能无法成立。所以黄兴主动说，不必选举，直接推举孙中山为总理。黄兴被选为执行部庶务，接受孙中山直接领导。宋教仁被选为司法部的检事（检察长），与孙中山是制衡关系。
同盟会
同盟会从一开始，就是一个松散团体。比较关键的是，孙中山以违反同盟会章程的方式成为总理，为日后的内部冲突埋下了伏笔。
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