1980年，考古專家穆舜英女士在新疆羅布泊地區，挖出了一具女性乾屍，距今有4000餘年。在出土時，由於這具乾屍膚色呈紅褐色，且富有彈性，眼大窩深，鼻樑高而窄，下巴尖翹，所以又稱她為“樓蘭美女”。
最初考察時，由於樓蘭美女面部具有明顯的中亞和北歐特徵，所以當時普遍認為她是歐洲人種，白人的血統。然而，在隨後的考古發現中，卻又挖出不少黑頭髮的樓蘭美女。
於是，樓蘭美女人種來源就成了一個謎團，一直困擾著歷史學家。前些年，藉助現代DNA技術，終於解開了樓蘭美女（下為復原圖）的真實身份。
從中國歷史記載來看，最早的記載源自《史記·大宛列傳》，所謂“樓蘭，古邑有城郭，臨鹽澤（羅布泊）。”當時，漢匈爭霸時，只是一個西域小國的樓蘭，夾在兩個大國之間，處境艱難。
公元前77年，被遺忘的西漢外交官傅介子，殺樓蘭王更其國名為鄯善。後來，《漢書·西域傳》中有比較詳細的記載：
鄯善國，本名樓蘭，王治扜泥城，去陽關千六百里，去長安六千一百里......（人口）口萬四千一百。
總之，在中國史書上留下不少記載的樓蘭古國，卻沒有一點樓蘭人種來源的記載。公元448年，傳承600餘年的鄯善（樓蘭）亡國。
從史料上找不到答案，對樓蘭美女人種起源問題，就只能告一段落。但隨著科技的發展，DNA技術的興起，樓蘭美女人種起源問題，有了新的研究手段。進入新世紀之後，上海復旦大學現代人類學研究中心有了新發現，顛覆了傳統認知。
DNA測定結論顯示：樓蘭美女的C線粒體顯示是東方人，而線粒體遺傳於母方。
也就是說，雖然樓蘭美女是北歐人種相貌，但從遺傳學上說，卻是東亞人種。顯然，樓蘭美女是東西方混合的人種，由此也能解釋出土的黑頭髮樓蘭人等情況。
對於復旦大學的這一結論，美國《紐約時報》都專門刊文報道。之所以這麼重視，因為從樓蘭美女身上，可以追蹤到中西方究竟何時、何地開始交流的答案。復旦大學該機構的金力教授評價：
新疆古代居民是東西歐亞大陸人群的混合人群，東西方交流比我們想象的要早許多。
傳統認為，中西方正式交流，應該起源於張騫出使西域，開創了絲綢之路。然而，從樓蘭美女身上卻能看到，在公元前2000年左右，中西方就已經有了交流。而這種交流的存在，必然會對各國文明進程等產生重要影響，當然也能解釋很多令人不解的考古發現。
在樓蘭遺址以東102公里的地方，考古專家發現了一座墓葬群。由於兩者相鄰，所以專家認為這一墓葬和樓蘭人應該關係密切。復旦大學也對此作了DNA技術研究，一共做成功20個樣本，結果18個的C線粒體是典型的東亞特徵。
至少在4000年前，東西方人種就已經在現在的新疆地區進行了文化和族群上的交流，這比以前我們所認為2000前東西方開始交流的年代早許多。新疆古代居民是東西方歐亞大陸人群的混合體，時間至少在4000年前。
顯然，在歷史的煙雲掩蓋之下，還隱藏了很多秘密。在4000年前，中西方古人究竟是如何交流的，屠刀還是包容？
在新疆的吉仁臺溝口遺址中，考古專家發現了一些來自中國北方的小米，而這一遺址距今3500年以上。顯然，如果將這兩者聯繫起來，或許可以猜想當時的中西方交流情況。
現代技術研究確認，維吾爾族和樓蘭人並非同一支。公元448年，樓蘭國滅亡，樓蘭城被棄，東西方混血的樓蘭人也神秘消失，樓蘭人究竟去了哪呢？
關於樓蘭突然消失之謎，有很多種分析，比如瘟疫說、戰爭說（當時處於五胡亂華期間）、環境惡化說等等，只是如今這每一種分析都缺乏確切的考古證據。
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