為了確保戰爭機器的高效運作，歷朝歷代統治者對軍隊將士的獎賞和撫卹都十分重視。清代沿襲明代制度，又作出了一些改變，對於那些在戰場上立功的將士給予了優厚的賞賜，即“功賞”。功賞主要包括攻城、陷陣和水戰三個方面，以下作詳細介紹。
就功城而言，分為雲梯功城，火炮攻城等幾種情況，還要視其攻城難度分別給賞。其中又有“攻下府城賞銀”、“攻下州城賞銀”、“攻下縣城賞銀”等幾種不同的賞銀標準。
以雲梯攻城為例，第一個攻入府城的賞銀250兩，州城200兩、縣城150兩；第二個攻入府城的賞銀200兩，攻入州城的賞銀150兩，攻下縣城的賞銀100兩。如此類推，攻入府城城池的前五人都給賞銀，以50兩為基準遞減。
衝鋒陷陣賞銀分為兩種情況，一是“凡強敵在前、陣堅壘固，能倡眾戰勝者”；二是交戰雙方“勢均力敵，有於本營中衝鋒前進者”。針對這兩種情況，朝廷按軍功分別給予50兩、40兩、30兩不等的賞銀。
水戰賞銀則分別船隻的大小（共分三等），依次賞先躍登敵船者前四人、三人、二人不等。比如，登一等船第一人賞銀100兩，二等船80兩，三等船60兩；登一等船第二人賞銀80兩，二等船60兩，三等船40兩。以20兩為標準，依次遞減。
上面所說的攻城、陷陣、水戰的定例在順治朝就以形成，且為以後歷朝所遵循。但當時八旗、綠營的軍功僅限於賞銀，至康熙朝三藩之亂期間，兵部認為只有賞銀不足以鼓舞士氣，因此奏議：“大兵所至之處，或敵人堅壁相距，或大列陣相迎，有能挺身先登，以及越眾衝鋒者，應各依立功等第，授予守備、千把總等官。至於先躍敵船立功者，應各依船大小等第，授以都司僉書、守備、千把總等官，並各給賞銀有差，以示鼓勵。”（清聖祖實錄卷47）
兵部的這個提議很快被康熙帝採納，此後，軍功的獎賞便將賞銀和授官相結合。當然，在特定的情況下，軍功賞賜又會有所變動。如在康熙統一臺灣是即重新訂立了賞賜標準。水戰中規定，若躍登偽藩坐船“本船每兵賞銀50兩，舵工賞銀100兩。兵丁第一名躍過船者，以參將用，賞銀500兩；第二名以遊擊用，賞銀300兩；第三名以都司用，賞銀200兩”，若是有臨戰退縮也有相應的懲罰，凡此，都在於鼓舞鞭策將士用命。
當然了，打仗肯定也會有傷亡，為此自康熙十三年以後確立了統一的撫卹制度，併為歷朝所沿襲。以綠營陣亡將士為例：提督800兩，總兵700兩，副將600兩，參將500兩，遊擊400兩，都司350兩，守備300兩，千總150兩，把總100兩，外委100兩，馬兵70兩，步兵50兩。
千總以上官員，除了撫卹銀之外，還有加級、蔭子和卹典的待遇。如副將的卹典為：加都督同知、都督僉事銜者，予祭二次，照例造墳安葬；未加銜副將任滿三年者，予祭一次，造墳安葬；未滿三年者，予祭一次，減半造墳。
如果參戰將領並非是戰死而是出征期間病死，也有相應的撫卹制度：“一二品提鎮以上，候旨遵行；其副將以下及三四品官賞銀50兩，五六品官40兩，七品以下30兩。”乾隆三十年又補充規定：“出征官兵行至五百里外病故者，照例給予恤銀；其在五百里以內者，減半給予；若行至一二站病故者，毋庸給予。”
出征將士陣傷制度要視傷情分為三等或五等：一等傷給銀30兩，二等傷25兩，三等傷20兩，四等傷15兩，五等傷10兩。
需要特別指出的是，上面所列的功賞、撫卹等制度在歷次戰爭中，也會出現一些變動。如在康熙二十二年平定臺灣之役中因軍費吃緊相應減少了標準。乾隆時期因國力強盛，幾次用兵又相應地提高了賞賜、撫卹的標準。總之，功賞和撫卹都遵循因時制宜，視國家財力和戰事而定。
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