中药材通过发酵技术处理以后，可以达到一下的目的：
1、 提高有效成分
中药材原料很广泛，很多都是家乡随处可见的小草。实际上，起关键药效的有效成分主要存在于植物细胞的胞浆中，胞浆被细胞壁、细胞间质包裹在植物细胞的内部，而细胞壁为植物细胞特有的细胞器，是由纤维素、半纤维素、木质素、果胶质等物质组成的致密结构。如此坚实的结构，致使在提取中药材的有效成分时，需要突破细胞壁和细胞间质的双重阻力才能溶解于提取介质中。
2、 减轻毒副作用
中药经发酵后，其毒性成分如生物碱类、内酯类、苷类、蛋白质类、重金属等被微生物分解转化，或对有毒成分进行修饰，可达到降低毒性或毒性消失的效果
3、 通过产生新的有效成分
例如李国红等人采用枯草芽孢杆菌对三七进行发酵后，对发酵后的皂苷成分检测，发现了生品中从未检测到的人参皂苷Ｒh4，表明这种新的成分是通过发酵转化而来。
4、 提高中药资源利用率
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