其實這裡存在一個誤解，一般人第一印象可能是穆斯林討厭基督徒，迫害他們，最後基督徒反擊，但是從歷史的角度看事實卻正好相反，下面就從教義和歷史上的十字軍東征來看看他們的隔閡在哪裡？
兩個宗教均從猶太教而出，信仰的都是祖先亞伯拉罕（易卜拉欣）的神，然而分歧就出現了，基督徒認為神曾經道成肉身化為耶穌，之後保羅又接受耶穌的感召轉向基督，用一套玄而又玄的邏輯闡明耶穌的話，也就是新神與新信仰，凡是後來在謊稱先知的都是假先知，異教徒是可憎的。：再來看伊斯蘭教，穆罕穆德像佛陀菩提樹下悟道一樣，在希拉山洞受到啟示決定奉上帝的名義創立最後的也是最完善的宗教——伊斯蘭教，來統一阿拉伯，而之前的耶穌（爾薩）作為上帝的靈氣是每個穆斯林應該敬仰的，但這世界上沒有任何人具有神性，而使徒保羅（鮑羅斯）篡改耶穌的話是可憎的，但基督徒作為有經人（範疇不限於宗教領域）是值得尊重的，要和他們和平共處。從上面的分析中大概能多多少少看出兩個宗教之間的不同了，似乎基督教更有可能被伊斯蘭教滲透，因此後來的基督教國家發起十字軍東征也不無道理了。
十字軍東征現在已經被基督徒視為反面例子了，認為當時那種行為是背離上帝心意的，但這也不過是現在人的說辭。關於十字軍為何東征最後致使兩個宗教真正產生歷史上不可調和的矛盾，上面所說的教義的衝突是根本原因，而直接原因卻僅僅只是當時一位教皇烏爾班二世的誇大其詞，下面是他為了煽動基督徒對穆斯林的仇視的演講稿。
正為大家所知，一個來自波斯的民族，塞爾柱土耳其人已經入侵我們東方兄弟的國家，他們一路攻到地中海，直到布拉聖喬治，在羅馬尼亞，突厥人七次攻打基督教徒，七次獲勝，又侵佔了我們的聖地——耶路撒冷，他們在大肆蹂躪上帝的國度，毀壞基督教堂，擄殺虔誠的上帝子民，汙辱貞潔的婦女，貪婪地飲著受洗兒童的鮮血。（與當時的歷史事實相悖）
如果讓那些魔鬼的奴隸統治主所信任的子民，那將是件多令人羞恥的事。如果你們仍然無動於衷，上帝的信徒就會在這次入侵中犧牲更多，所以我要勉勵你們，也懇求你們——不是我，是主親自勉勵你們，基督的使者們，督促一切有封爵等級之人，乃至所有騎士、士兵、富人與窮人，都必須迅速予以東方基督教徒援助。把兇惡的民族趕出我們的領土，我告訴在座的各位，也通知不在場的人：這是主的旨意。
…………
凡動身前往的人，假如在途中，不論在陸地或海上，或在反異教徒的戰爭中失去生命的，他們的罪愆將在那一瞬間獲得赦免，並得到天國永不朽滅的榮耀。向著東方出發吧!不要猶豫，不要彷徨，為榮耀我主，去吧!把十字架染紅，作為你們的徽號，你們就是‘十字軍’，主會保佑你們戰無不勝!
你們總是時刻進行著不公的戰爭;你們總是因為貪慾和傲慢而揮舞著武器自相殘殺，對此你們將遭受永恆的死亡與詛咒。而我們現在將引領你走向帶來永不朽滅的榮耀的戰爭。
就這樣，被歷史學家公認為愚蠢的反人類罪行的十字軍東征不但徹底將兩個原本還可以對話的宗教徹底拉入水深火熱之中，同時這場十字軍東征也導致了東羅馬帝國的衰落和中世紀溫和的穆斯林為了對抗基督國家不得不把“聖戰”一詞強化再強化以至於現在伊斯蘭原教旨主義和各式各樣的恐怖活動。
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