光线和射线对微生物的影响随其性质、强度、波长、作用距离等的不同而不同。紫外线、X线、γ射线等波长较短的光线有杀菌作用，普通可见光对细菌作用不大，红外线杀菌仅有热的作用。
1）非电离射线
①日光和紫外线：日光为最经济最方便的杀菌因素，许多细菌在日光直接照射下均易死亡。这主要在于其中的紫外线，紫外线杀菌的有效波长为260～270nm，最佳波长为260～266nm的紫外线杀菌力最强。紫外线的杀菌原理为使细菌DNA链上相邻的嘧啶碱基形成嘧啶二聚体，从而干扰DNA正常碱基配对，影响DNA的复制，导致细菌死亡或变异。
紫外线杀死不同种类细菌所需要的照射剂量不同，革兰阴性菌最易被紫外线杀死，革兰阳性菌，如葡萄球菌则需增加照射量达5～10倍，芽孢需增加照射量10倍以上，真菌孢子需增加50倍的照射量才能被杀死。所以，在细菌学检验工作中，真菌实验室与细菌实验室分开使用为宜。
紫外线的特点：穿透力差，不能穿过普通玻璃、尘埃，所以只能用于直射物体表面和空气的消毒。常用于实验室、病房、外科手术室的空气消毒及白大衣、超净台的消毒。进行室内消毒时，紫外线灯应距地面2.5米，室内清洁无尘，湿度控制在50%以内，时间为0.5～2小时。
注意事项：紫外线灯照射时，注意人体皮肤、黏膜、眼睛的保护，切不可直接接触紫外线。紫外线消毒时产生的臭氧对人体有害，故紫外线消毒停止后30分钟才可入室工作。
②光感作用：可见光的杀菌是通过某些染料发出荧光，与紫外线作用相同而杀灭细菌的，称为光感作用。如伊红、红汞、美蓝对革兰阳性菌有光感作用，沙黄对革兰阴性菌有光感作用。
2）电离辐射：电离辐射的穿透力及杀菌力都比较强，常用于杀菌的电离射线有γ射线和高能量的电子束（阴极射线）。γ射线是由放射性同位素60Co产生的，消毒物体由传送带送入，环绕钴源移动，使之各侧都受到规定量的照射，达到消毒目的。因其灭菌时不升高温度且穿透力强，故特别适于忌热物品的灭菌或消毒，常用于一次性塑料制品的消毒，如一次性过滤器、注射器、手套等。
高能电子束是由电子加速器产生，其穿透力较γ射线差，只能用于较小的物体杀菌。
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