DSI校友使用計算設計來快速發現COVID-19的治療方法

哥倫比亞大學數據科學研究所(DSI)的兩名畢業生正在使用計算設計來快速發現冠狀病毒的治療方法。

安德魯·薩茨(Andrew Satz)和佈雷特·阿韋索(Brett Averso)分別是EVQLV的首席執行官和首席技術官。他們將他們的技術用於發現最有可能幫助那些感染了COVID-19病毒的人的治療方法。機器學習算法以很高的成功率快速篩選治療性抗體。

DSI校友使用計算設計來快速發現COVID-19的治療方法


在實驗室進行抗體發現通常需要數年的時間,算法只需一週就能識別出能夠對抗病毒的抗體。加速開發一種可以幫助感染者的治療方法是至關重要的,Satz說,他是2018年DSI校友,並於2015年畢業於哥倫比亞大學普通研究學院(SchoolofGeneralStudies)。

我們正在減少尋找有希望的抗體候選人所需的時間。研究表明,在實驗室發現和優化抗體平均需要五年半的時間。我們的算法可以大大減少時間和成本。“

安德魯·薩茨

加快這一過程的第一階段--抗體發現--對加速發現對COVID-19的治療有很大幫助。EVQLV通過計算抗體發現和優化,將有前途的抗體基因序列發送給實驗室合作伙伴。實驗室技術人員然後工程師和測試抗體,這一過程需要幾個月,而不是幾年。被發現成功的抗體將轉移到動物研究和人類研究上。

鑑於對抗冠狀病毒的國際迫切性,Satz說,在2020年年底之前,有可能為病人準備好治療。

他補充說:“我們的算法所做的就是降低實驗室藥物發現失敗的可能性。”“我們儘可能地在計算機上失敗,以減少實驗室下游故障的可能性。這就節省了大量的時間,無法完成繁重而耗時的工作。”

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同時也是2018年DSI校友的Averso說,EVQLV正在設計的一些抗體是為了防止冠狀病毒附著在人體上。正確的抗體結合在位於人類細胞和冠狀病毒表面的蛋白質上,就像鎖和鑰匙一樣。這種結合可以阻止病毒在人體內的擴散,有可能限制疾病的影響。

他還指出,科學界和生物技術產業受到激勵,建立合作關係,以儘快實現治療、診斷和疫苗。

EVQLV與免疫抗體(IPA)合作,這是一家致力於發現治療性抗體的公司。這項合作將加速開發針對COVID-19的治療候選藥物。EVQLV將在短短几天內識別和篩選數億種潛在的抗體治療方法,遠遠超出任何實驗室的能力。IPA將生產和測試最有希望的抗體候選。

Satz和Averso是在DSI的學生們相識時認識的,他們堅定地致力於使用“數據為好”。兩人在數據科學和衛生保健的交匯處合作了幾年,並於2019年12月成立了EVQLV,利用人工智能加快發現、開發和交付治療的速度。該公司已經成長為12名團隊成員,擁有從機器學習和分子生物學到軟件工程和抗體設計、雲計算和臨床開發等各種技能。

這兩位DSI畢業生通常每週工作100小時,因為他們熱愛並致力於利用數據科學“幫助治癒那些需要幫助的人”。

“我們正在建立一家位於人工智能和生物技術前沿的公司,”Satz說。“我們正在努力工作,加快發現和交付治療的速度,不能要求一個更有成就感的任務。”


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