有点肿的神射手
哎呀我的天！看了题主的这个问题，本人就被难住了。这明显是一个相当专业的生理学问题。
抱歉，本人在大学学的却是生物学。有所涉及。
所以接下来的所述只是皮毛。
关于小男孩和小女孩长相不一样。我们可以这样理解，我们身体是由不同的组织组成，不同的组织由不同的细胞构成，不同的细胞是由不同的基因表达而成。
初始一段时间，小男孩和小女孩不能很明显地分辨出，是因为他们的身体都还处在生长发育阶段，相貌特征的基因表达没有完全。
到了第一性征出现的时候，也就是男女孩的下面开始变得特征明显的时候，此时主导的是遗传物质——染色体。
众所周知，男的染色体是XY，女的染色体是XX。到了第二性征出现时，Y染色体上的基因充分表达，体内性激素开始分泌，让男孩具有男人具备的所有特征，包括，喉结，汗毛，体质强壮，肌肉发达等。X染色体的基因表达，让女孩具备女人所有的特征，包括，皮肤细腻，乳房发育等。造成了小男孩和小女孩长相就不一样。
总之，性激素分为雄激素和雌激素两种，雄激素持续作用于男性，雌激素持续作用于女性。使得两者在性征和外貌上显得不同。
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一切最核心的还是基因，男孩和女孩从生物学角度的区别是染色体不同，女孩是X，男孩是Y。面相的遗传可能来源于母亲，也可能是父亲，同时也与显隐性有关。如果控制面相的基因都基本相同，而男孩和女孩长相还是有差异，是因为，男孩和女孩体内分泌激素的量不同，从而影响骨骼，体质等方面，如雄性激素量多更加促进毛发，骨骼等发育。基因表达是多方面，多层次，基因可以影响酶活，激素，蛋白质等各方面的合成，从而到可见的形状。另外，激素是生长发育不可缺少的，因此男孩女孩均需要激素，自身也分泌激素，切都有雄性激素和雌性激素，只是量有差异。
风与影
小女孩和小男孩在青春期之前，长相上没有什么区别，真正的区别在于孩子的着装打扮和发型。也不会分泌性激素，有人会有疑问，那为什么小男孩都特别的闹，小女孩就特别的安静呢？有两个原因，一个是孩子的天性，从娘胎里带出来的，这个无论男孩女孩，比如说小男孩新欢玩具汽车和枪，而小女孩喜欢布娃娃。还一个关键因素就是环境，在孩子成长的环境中，孩子是张白纸，而在他周围的环境中，家长认为他是个男孩，就会以男孩的思维培养他，就会越来越有男子气概。
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小男孩和小女孩长相基本一样，主要还是看性格，女孩子小时候活泼一点，男孩子反而相比较就安静一点。
雄性激素是由睾丸合成和分泌的，正常男孩10到13岁就开始进入青春期，进入青春期以后就开始分泌雄性激素，所以童年基本没有性激素分泌。
风尘浊酒
所有人在最初的胚胎状态都是女孩。男孩其实是在女孩的基础上加入了染色体Y之后改装的。大约在胚胎发育的第八周，男孩细胞里面的染色体Y开始活动，睾丸素开始分泌。睾丸素是导致男孩和女孩不同的根本原因。
男性儿童进入青春期后，睾丸开始分泌雄激素，以促进生殖器官的发育，出现第二性征并产生性欲。一般从10-11岁开始。
女性进入青春期后，卵巢开始分泌雌性激素，以促进阴道、子宫、输卵管和卵巢本身的发育，同时子宫内膜增生而产生月经。雌性激素可以使皮肤保持水分，促进皮肤新陈代谢及血液循环，使皮肤柔嫩、细致，还会使乳腺增生，产生乳房、乳晕，并将脂肪选择性的集中在乳房、大腿 、臀部，以此让女性的身材优美且有曲线，产生并维持女性的第二性征。
天汉之子
父亲提供的精子有X,Y之分，与母亲的卵子X,X结合成为男孩XY或女孩XX。因此在染色体结合的那一刻就决定了孩子的性别，当然从那时候就决定了它以后的性激素分泌情况。所以随着男孩女孩的生长发育性别长相动作等差别也就越来越显著，当然后天的生存环境等影响也是有的。
瞧这蜗牛
所有人在最初的胚胎状态都是女孩。男孩其实是在女孩的基础上加入了染色体Y之后改装的。大约在胚胎发育的第八周，男孩细胞里面的染色体Y开始活动，睾丸素开始分泌。睾丸素是导致男孩和女孩不同的根本原因。
十四叔的家常便饭
基因染色体不同 性格不同。小的时候男女长相并没有太大区别。还有一个主要原因是家长从小给予的性别区分，男孩 女孩 从小从穿着打扮玩具上有了明显的性别划分 让孩子在小的时候逐渐培养了性别意识
