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在养鸡中，鸡舍消毒很重要。从环境角度来说：清洁的环境是控制疾病的基础，那么如何才能保持清洁的环境。消毒的作用就是将病原体杀灭，降低养鸡环境中的病原微生物的浓度，防止外部病原体进入鸡场内。
空舍的消毒
入维前空舍的消毒不容忽视，消毒前一定要将舍内的杂物彻底清理，打扫灰尘，防止有机物的存在降低消毒药的效果。再用清水冲洗，最后用消毒药进行消毒。消毒结束后一定要把鸡舍的门窗封闭，防止飞禽进入鸡舍，造成污染。入雏前再熏蒸消毒一次。另外，不仅要注重舍内的消毒，舍外的消毒也不容忽视。舍内消毒的同时也要把鸡舍外围的消毒工作做好。对于消毒药的选择，我们要选择中效和高效的消毒药，稀戊二醛，聚维酮碘（可以带禽消毒）浓度按要求就可以，没必要用很高的浓度，造成不必要的浪费。另外，场门设立标牌，禁止人、畜出入。另外，对被诊断为高致病性禽流感、新城疫、马立克氏病的病鸡要进行捕杀并对尸体进行无害化处理。消毒用热水（水温50℃左右）比较好，因为，高温时反应快，效果提高，低温条件下消毒效果不佳。
带禽消毒
带鸡消毒要在清粪、打扫卫生之后，减少环境中的污物，可发挥更好的消毒效果。消毒前，舍温提高2~3℃，在湿度高的季节，消毒后1h通风换气，同时选择合适的时间进行消毒，减轻消毒带来的应激反应。另外要选择对人、鸡刺激性小，对物品腐蚀小的消毒药。在日常消毒时几种消毒药，要交替使用，避免长期使用一种消毒剂产生耐药性。一般用水量为50~100ml/m2.根据舍内环境的污染程度，每天或隔天消毒一次。带鸡消毒时雾滴越小，消毒液在空中悬浮的时间越长，消毒效果越显著。
饮水消毒
水质要清洁、卫生，最好使用深井水。若使用地表水或浅层地下水源，地面流入的细菌就难以控制。我们会发现，每下一场大雨之后，大肠杆菌的出现率就增加。建议在饮用水中添加漂白粉，开放式饮水中含氯3gt,乳头式饮水中含氯2gt,可以有效降低水中的杂质。
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