“天人合一”是中国古代哲学中关于天人关系的一种学说。指天与人的关系紧密相联，不可分割。强调天道与人道、自然与人为的相通和统一。而《黄帝内经》中的天人合一观，更是标志着中国医学由经验医学上升为了理论医学。
中国古文明的特点是天人感应、天人合一。人是天地造化之物，人是天地万物存在的一种物质状态，同固态、液态、气态、粒子态等一样，这是生命态。所有的动物都不是前四态的简单复合，而是需要元神注入的生命态，这一点是现代科学所不能理解的。天人感应、天人合一的主要内容包括天人同时、天人同构、天人同炁、天人同振、天人同化等五大方面。
天人同时，即人的各种时间结构全息同化于天地的时间结构，如人体的藏象经络与古中医的五运六气、三式河洛、阴阳五行、四柱六爻等各种时间结构，这个时结构在易学和古历法中叫做“数”，包括先天数、后天数、河图数、洛书数、干支数、卦数、斗数、历数等，统称“气数”。如果掌握了这种天地人的时间结构运行规律，即可预测事物的发展趋势，时间流的过去、现在、将来都是掌握之中的事。这是天人合一的时间结构层面。
天人同构，即人的各种空间结构全息同化于天地的空间结构，这个空间结构在易学和古历法中叫做“象”，如人体的藏象经络与古中医的五运六气、三式河洛、阴阳五行、四柱六爻等各种空间结构，我们常说的“乾三连，坤六断，震仰盂，艮覆碗，离中虚，坎中满”，以及九宫飞星、各式排盘、河洛布局、司天在泉、左右间气、应爻世爻、浑天、盖天、橐龠等就是这种空间结构，现代科学将这种“象”称为“模型”。《黄帝内经》中也经常将天地结构比喻成人体结构，或将人体结构比喻成天地结构。人身小宇宙，宇宙大人身。如果掌握了这种天地人的空间结构运行规律，那么时间结构发生的空间定位就变得易如反掌了。这是天人合一的空间结构层面。
天人同炁，空间结构是静止的，时间结构是静止的空间结构运动所构成的。即运动的空间结构构成时间结构，这在易学中叫做“理”或“道”。而空间结构的物质基础就是这个“炁”，古中医叫做“精气神”，现代物理学叫做“高能粒子”。结合在《众妙之门》中所说的另外空间理论，或者叫做层创时空理论，就可以推论出天人可以有不同层次的“气”，所以就出现了凡人、君子、至人、贤人、真人、圣人、神人、罗汉、菩萨、佛、道等不同层次与时空境界的生命形式，这是天人感应的物质基础。只有天人感应的演化，才有天人合一的升华，这个演化与升华的过程就是修炼，就是佛、道、儒、圣等宗教的实质内涵。
天人同振，即人天的同步共振。高层次的天人同振叫做“神通”，中级层次的天人同振叫做“法术”，低层次的天人同振就是“数术”。“神通”包括天目（肉眼通、天眼通、慧眼通、法眼通、佛眼通）、宿命通、他心通、大小搬运法等成千上万不止。“法术”就是我们平时所说的“功能”一类，这是利用三界内的一点能量与物质运动规律，根据各种日月五星天体布局在小范围内制造的一些顺势而为的小神迹、空间流，例如古中医、堪舆、祝由、丹道修炼等。“数术”就是预测、占卜，通过各种排盘预测事物的时间流，如三式、四柱、六爻等。
这里有必要说一下中医。低级层次的中医就是通过四诊八纲、各种辨证（脏腑、六经、三部、气血津液、三焦等）来分析疾病的病因病机，根据经验来遣方用药（时方）；中级层次的中医已经开始运用关于年月日时之时空流的运气理论、象数理论去计算疾病的病因病机、汗瘥棺墓等预后，按照《汤液经法》《伤寒杂病论》的法则去处方（经方）；高级层次的中医直接运用神通去治疗疾病了。我们现代的中医多按照经验治病，只有1%左右的中医是运用运气理论、象数理论，通过法术、数术去治病。至于神通治病的中医就完全没有了，只有那些著有《黄帝内经》《黄帝外经》《扁鹊内经》《扁鹊外经》《神农本草经》的人才是真正有神通的大医。古代的张仲景、华佗、淳于意、孙思邈等是介于法术、数术与通之间的中医。经验中医就是传统中医，而法术、数术中医与神通中医可称为古中医。而现代中医严格意义上可以说不是古中医。
天人同化，实质上就是佛、道、儒、圣等宗教中的修炼者，达到高度天人合一的程度，最后由量变要发生质变，产生一种生命体形式的升华，佛家叫“涅槃”“虹化”，道家叫“白日飞升”“尸解”，儒家叫“坐忘”，基督教叫“复活”，总之就是宗教中的“圆满”，得到不同境界的果位、世界。
古中医认为，人只是天地五虫之一的“倮虫”，同其他四虫一样，都要受天地之气的制约。而且天地万物皆是如此，在运气九篇中就有大量篇幅论述了六气司天在泉时，天地之间动植物的生长化收藏的规律，这些都说明了“人时”与“农时”都属于“天时”，而历法的主要功能是决定内算系统，敬授人时，以和天时，从而达到天时、地利、人和的天人合一状态。而农时只是最基本的时间结构，人时才是历法与内算要服务的主要对象。
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