1853年（清咸豐三年）生於甘肅東鄉果園村。
1860年（清咸豐十年）開始學習阿拉伯語。
1866年（清同治五年）在東鄉紅崖清真寺唸經。
1868年（清同治六年）在瓦里家清真寺唸經。
1875年（清光緒元年）在北莊拱北清真寺穿衣，正式授予阿訇資格，被聘任果園清真寺阿訇。
1878年（清光緒四年）聘為東鄉巴素池清真寺阿訇。
1886年（清光緒十二年）和瓦里家老阿訇、馬會三同往聖地麥加朝覲。期間在麥加知名學者海力力巴夏和艾卜·蓋勒二人門下學習。
1892年（清光緒十八年）辭別了海力力巴夏和艾卜·蓋勒回國。
1893年（清光緒十九年）路過陝西安康留任安康清真寺開學。
1894年（清光緒二十年）路過東鄉科妥，留科妥清真寺開學。
1896年（清光緒二十二年）潛避靜寧縣城關大寺由馬良駿阿訇介紹到靜寧南鄉清真寺開學。
1897年（清光緒二十三年）被聘任臨夏莫尼溝何家清真寺開學，招收50多名大滿拉開始講學活動。
1907年（清光緒三十三年）各門宦要求懲辦，因而去湖北老河口清真寺擔任阿訇。
1911年（清宣統三年）辭去老河口開學阿訇的職務，回到家鄉，在此期間，由於伊赫瓦尼發展較快，並和各門宦之間發生爭端，各門宦告他是“策劃造反的首惡”，因此馬安良下令他在“甘肅境內不準開學”。
1915年（民國四年）帶家屬離開甘肅，前往酒泉，他的長子穆罕默德·馬遇真被聘任為酒泉清真寺阿訇。
1916年（民國五年）9月，攜眷從酒泉到哈密，被哈密王沙莫胡索特安置在王府寺裡講經。
1917年（民國六年）12月，新疆總督楊增新下令哈密縣長逮捕了馬萬福和馬遇真、馬遇道。
1918年（民國七年）1月，將馬萬福裝入木箱，給馬遇真和馬遇道帶了腳鏈手銬，置囚車押解蘭州。
1918年（民國七年）2月，西寧鎮守使馬麒疏通甘肅總督張廣建要求將馬解往西寧，如有不軌行為願以性命擔保，在得到了張廣建的默許後，馬麒派員前往永登縣境之沙溝將馬萬福父子三人接到西寧。
1918年（民國七年）10月，聘為上五莊邦巴鎮清真大寺開學，在此期間，他招收有相當阿語知識的經師講授經典，傳播知識，在8年時間裡，培養出了一批有名的經師。
1926年（民國十五年）5月，被聘為魯沙爾清真寺教長，招收了40多名滿拉，通過講經宣教進一步宣揚伊赫瓦尼的遵行。
1934年（民國二十三年）馬萬福歿於西寧市、享年81歲。
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