大多数抗甲状腺药物只抑制甲状腺激素的合成，而不抑制外周T4转化为T3，因此治疗过程中，T4比T3下降得早，只有当T3降至正常（此时T4可能正常，也可能已低于正常），才表明甲亢得到控制，用药量适当，可按原药量继续服用。T3仍高于正常表明用药量不足，应适当加量。当T3和T4皆低于正常则示药量过高，需适当减量。
Graves病在选择治疗时，可参考TRAb的结果，当甲状腺生长免疫球蛋白TGI活性增高而刺激甲状腺免疫球蛋白TSI（TSAb）阴性时，宜采用外科手术或放射性碘治疗。
甲亢治疗效果的判断
药物治疗一个过程后，应停药6周测定T3、T4以判断疗效。T3和T4恢复正常说明甲亢已明显缓解。为了解是否已经治愈，则需进行甲状腺激素抑制试验或TRH兴奋试验。结果正常证明下丘脑-垂体-甲状腺轴功能已恢复正常，甲亢治愈，停药后复发率低。对Graves病，还应检测TSI（TSAb）的活性水平，如TSI（TSAb）仍呈阳性，提示免疫功能尚未恢复正常，如过早停用抗甲状腺药物，多在短期内复发。
甲亢患者甲状腺摄碘131功能的变化比临床表现和甲状腺激素的恢复为慢，所以不能单独用甲状腺摄碘131试验来监测用药量和判断疗效。
甲亢是否复发
甲亢治愈后有一定的复发率，应及早发现，最好是发现于亚临床甲亢期，进行及时治疗。各种测定方法对早期发现甲亢复发的灵敏度和可靠程度的顺序是S-TSH=TRH兴奋试验>FT3>FT4>TT3>TT4.
注意：甲亢患者在药物治疗，切莫自己随便停药，减药，有很多患者自身感觉甲亢症状消失了，自己停药，往往会比之前更严重。所以一定要遵医嘱，即便停药患者也要定期去复查，一旦有复发及早的治疗。
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