崇祯皇帝迁都面临几个问题：
一，迁都导致北方防守更空虚，和丢弃没有什么两样。这样一来，北方一定失守，这个责任就是同意南迁的人来负责。崇祯帝不想背负这个责任，于是让内阁去决定是否南迁，内阁也不傻，不敢做这个决定。就在双方推诿时，李自成来到了。
二，历史上迁都的皇帝没有几个有好下场。东汉的汉献帝，从洛阳到长安，从长安到许都，最后皇位都没了。唐玄宗南迁入蜀，结果皇位被自己的儿子夺走了。金宣宗从燕京到卞梁，也没能避免金朝的覆灭。
崇祯帝最担心的是南迁之后，自己会像唐玄宗一样被迫禅位给自己的儿子。或者更可破怕的是，自己的儿子像唐肃宗一样不告而即位。甚至担心李自成在夺取北方之后拥立朱氏宗室在北京称帝，让自己的合法性受损。
三，是人心问题。一旦南迁，北方等于放弃，世代居住在北方的官吏和士兵就不会为明朝卖命，明朝的人心就散了。即便崇祯帝能保住半壁江山，但无力收复。崇祯帝不能接受自己既是宋徽宗又是宋高宗的角色。
四，虽然南京也有一套官职，但因为家眷等，南迁的费用也不低。本来财政就很紧张，一旦南迁，必然有所顾及不到，形成哀怨遍地，形成民怨。另外，南京突然涌入几十万，压力也不小。
崇祯南迁并非最佳策略
从历史来看，东晋，唐玄宗唐肃宗父子，宋徽章宋高宗父子等等情况来看，南迁后政权想要稳定，必然需要更换皇帝。
原因很简单：
新皇帝，新作风，新班子，新活力。
老皇帝如果能做到，就不会沦落到这个境地。隋炀帝自己心灰意冷，但又没有传位，导致隋朝灭亡。这就是明证。
当时的明朝需要更换皇帝，似乎太子是最好的人选，但崇祯帝自己又不肯———否则他早就同意让太子去南京坐镇防止北京失守后的预案。
崇祯帝在北京，太子在南京，似乎是当时明朝的最佳选择。太子在南京，就不会有南明的拥立之争和左良玉以太子为号的内斗。
但崇祯帝恋权，导致了南明根基不稳，最后因为内斗而亡。
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