1942年，抗日戰爭進入第五個年頭。國軍節節敗退。國民政府為解決日益膨脹的財政需要，用美國對華5億貸款中的1億元作為基金，在國統區發行“同盟勝利美金公債”。每元摺合國幣20元。人民以國幣購買，待抗戰勝利後兌還美元。但各地人民均採取多購不如少購，少購不如不購的消極態度，發行情況並不順利。至1943年秋末，全國實際售出還不到預定計劃之半，約4300萬美元。
孔祥熙
已購之人，也不很相信將來會兌還美金，因此大多在購得後即轉來脫手。但是，由於通貨膨脹，國幣貶值，美金公債券價值逐漸提升，由美券一元可值國幣20元發展至可值273元。
由於美金公債券價格持續上漲，身為行政院副院長、財政部長和中央銀行總裁的孔祥熙，於1943年10月9日致函蔣介石，申請於10月15日結束美金公債的發售。他向蔣表示，“當督促行局主管人員妥為辦理，以期早日完成。”屆期，財政部密函國庫局，命令立即停止銷售美券，各地尚未售出的美券，全數由中央銀行業務局購進，上繳國庫。
孔祥熙
可是，當時的國庫局局長呂鹹卻從中看到機會，企圖乘機舞弊，損公肥己。他於1944年1月命債券科科長熊國清代擬了一個簽呈，寫得冠冕堂皇，似乎既符合國家發行公債的目的，而且照顧到國庫局員工的利益。
但是，當時美券一元的最高市格已經飛漲到國幣250元，而國庫局的員工卻可仍以20元的低價購得；尚未售出的美券5000餘萬元，其市價將達125億國幣。按照呂鹹的辦法，這筆天文數字的鉅款就可以成為國庫局少數人的財富。對於這樣一個損公肥私的簽呈，身為中央銀行總裁的孔祥熙居然批了一個“可以”，並加蓋了“中央銀行總裁”的官章。
據後來在國民參政會上提案揭發的參政員陳賡雅說：呂鹹利用合法手續後，於1944年2月首先孝敬孔祥熙美金公債券350萬元，其後，又用以票換票，買空賣空的辦法貪汙美券近800萬元。兩項合計，共1150餘萬美元，摺合國幣約26.47億元。
蔣介石和孔祥熙
孔祥熙、呂鹹等人如此明目張膽地貪汙，自然不能做得天衣無縫。1945年春，國庫局的兩個有良知的年輕人拉開了反腐的序幕, 他們通過知名人士和輿論開始向重慶國民政府秘密檢舉。蔣介石發現了事情的嚴重性，決定交財政部長俞鴻鈞徹查。同年11月，孔祥熙卸任財政部長，俞鴻鈞繼任。
俞鴻鈞接手美金公債案後，於4月8日向蔣介石提交了一份查賬報告，其情況是：“美金公債自停止出售以後，所剩五千萬左右也幾乎售完。買主用的都是一些別名，地址含糊不清，有的甚至是南京、上海等淪陷區的地址。” 蔣閱後認為“其中有詐，應徹查”。
孔祥熙
1944年6月，孔祥熙被派赴美，出席國際貨幣基金世界銀行會議。他患有膀胱結石病，會後即留在美國治病。1945年4月10日，蔣介石致電在紐約的孔祥熙，指出在停售美金公債後，仍有1100萬餘債券在繼續交易，應予追繳。歸還國庫，不得貽誤，並將追繳之確數呈報。
4月11日，孔祥熙覆電稱：”俟弟病稍愈，即當回國親自處理。”通過追查，蔣介石已經初步掌握案情，但是，孔祥熙不回國，調查難以深入。後來，蔣介石發現尚差數1660餘萬元不知去向。這1660餘萬美金公債的差額就是蔣介石要追查的地方。5月22日，蔣介石因中央銀行業務局的黃金舞弊案發現重大嫌疑，電召孔祥熙速回。
孔祥熙一回國, 立刻組織18個人進行造假. 因為人證物證確鑿, 蔣介石大怒。
蔣介石家族
同年5月5日，國民黨在重慶召開國民黨第六次全國代表大會。19日，選舉國民黨新一屆中央委員。由於孔是蔣的姻親，宋藹齡、宋美齡拼命“護孔”，蔣在財政上也要依賴孔，因此，外面雖反孔，而蔣介石卻常加維護。此後，社會“反孔”情緒更趨強烈，蔣介石不能不考慮換人。次日，蔣介石宣佈，他本人和孔祥熙分別辭去行政院正副院長職務，改以宋子文、翁文灝充任。
孔祥熙和宋靄齡
再後, 孔祥熙辭去了所有職務, 退出所有贓款,蔣介石並沒有 懲罰他,對此事不了了之。
1947年秋，孔祥熙以陪護宋靄齡治病為由，由上海赴美國紐約定居。
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