日前，《Nature》杂志在线发表了美国生态健康联盟Kevin J. Olival研究员和Peter Daszak研究员的一项病毒学重要研究成果，研究组利用创建的庞大数据库，分析了动物携带多种病毒传人的可能性。该研究识别了影响病毒能否由动物传播给人类的重要因素，并给出最有可能对人类健康构成新威胁的地理位置，以及哺乳动物物种的图谱。
人类免疫缺陷病毒(HIV)、埃博拉病毒和严重急性呼吸综合征(SARS)等大多数新发人类传染病，其实源于野生哺乳动物，因此，需要特别警惕人畜共患病毒。预测哪些病毒最有可能由动物传染给人类，非常有助于卫生项目监控新发疾病，预防未来的疫情暴发。
哺乳动物的基因组可被逆转录病毒感染,而且病毒可在不同物种间转移,例如分别由黑猩猩和白眉猴传染给人的免疫缺陷病毒HIV-1和HIV-2。通常,前病毒(provirus)可以整合到宿主生殖细胞系的基因组,成为内源性逆转录病毒(endogenous retrovir-us,ERVs),并伴随宿主垂直传播和进化。已有的研究证实,灵长类的基因组内有相似的ERVs残迹序列,且这些残迹序列位于相似的基因座,因而有学者认为ERVs可以直接反映人同
其它灵长类的近亲关系(Griffiths,2001;Villesenet al·,2004)。另外,研究还发现ERVs可以调节宿主基因组的结构,在外界刺激下活化并产生成熟的感染性病毒颗粒,因此可能是某些外源性逆转录病毒(exogenous retrovirus)的祖先(Liu&Soper,2009)。本研究中，研究者创建并分析了一个包含2800多种哺乳动物—病毒关系的数据库，该数据库增进了人类对人畜共患病毒跨物种传染影响因素的理解。在其分析的586种病毒中，263种(占44.8%)曾在人类中被检测出来；188种(占人类病毒的71.5%)病毒属于人畜共患病毒，即至少曾在人类和其它哺乳动物中各检出过一次的病毒。
通过对人畜共患病毒的地理热点预测分析发现，宿主不同，病毒的地理模式也不同。例如，来自蝙蝠的人畜共患病毒在南美洲、中美洲和亚洲一些地区最普遍；而来自灵长类动物的病毒往往集中在中美洲、非洲和东南亚；来自啮齿类动物的病毒则多见于南北美洲和非洲中部
Kevin J. Olival称以上结果将能协助全球病毒发现项目去识别新型人畜共患病毒，并评估它们对人类健康的潜在威胁。
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Host and viral traits predict zoonotic spillover from mammals
原文摘要：
The majority of human emerging infectious diseases are zoonotic, with viruses that originate in wild mammals of particular concern (for example, HIV, Ebola and SARS). Understanding patterns of viral diversity in wildlife and determinants of successful cross-species transmission, or spillover, are therefore key goals for pandemic surveillance programs. However, few analytical tools exist to identify which host species are likely to harbour the next human virus, or which viruses can cross species boundaries. Here we conduct a comprehensive analysis of mammalian host–virus relationships and show that both the total number of viruses that infect a given species and the proportion likely to be zoonotic are predictable. After controlling for research effort, the proportion of zoonotic viruses per species is predicted by phylogenetic relatedness to humans, host taxonomy and human population within a species range—which may reflect human–wildlife contact. We demonstrate that bats harbour a significantly higher proportion of zoonotic viruses than all other mammalian orders. We also identify the taxa and geographic regions with the largest estimated number of ‘missing viruses’ and ‘missing zoonoses’ and therefore of highest value for future surveillance. We then show that phylogenetic host breadth and other viral traits are significant predictors of zoonotic potential, providing a novel framework to assess if a newly discovered mammalian virus could infect people.
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