阿塞拜疆与亚美尼亚为争夺纳戈尔诺—卡拉巴赫自治州，从1986年7万多亚美尼亚人签名上书苏共中央，要求将该州划归亚美尼亚共和国管辖开始，就一直高潮迭起，冲突不断。双方卷入人数均超过了百万。1988年11月22日和1989年9月2日在阿塞拜疆首府巴库举行的两次抗议亚美尼亚人要求改变纳戈尔诺—卡拉巴赫自治州归属的游行示威的参与者都多达50万，四分之一的巴库人参与了示威抗议。
1989年11月28日，苏联最高苏维埃通过了结束对纳戈尔诺—卡拉巴赫自治州特别管理的决议，决定把它交还给阿塞拜疆管辖。莫斯科当时这样做是为了迫使两个加盟共和国通过谈判解决相互间的争端。事实证明莫斯科这样做是一个悲剧性的失误。
这使阿塞拜疆和亚美尼亚两国民众的骚动情绪不断发展。1990年1月11日巴库再次举行了大规模群众集会，1月13日阿塞拜疆发生了史上最为严重及残酷的骚乱。阿塞拜疆极端民族主义者向亚美尼亚人居住的公寓发起攻击，并屠杀了住在大楼里的亚美尼亚人。还将妇女和儿童从窗口摔下，惨死在大街上。阿塞拜疆人针对亚美尼亚人的打、砸、抢、奸、烧、杀遍地皆是。
阿塞拜疆人洗劫并烧毁亚美尼亚居民的房屋,驱赶屠杀亚美尼亚人。在愈演愈烈的破坏和杀戮面前,大多数亚美尼亚人逃离巴库,造成严重的难民问题。
1月16日,阿塞拜疆和亚美尼亚为争夺纳戈尔诺一卡拉巴赫州的民族矛盾再度激化。至使苏维埃最高主席团宣布在该地区实行紧急状态,并派遣陆军、海军陆战队和安全保卫部队进驻部分地区。
1月21日，苏联军队完全控制了巴库，但是这座城市并不平静。阿塞拜疆最高苏维埃一致通过了一项决议：如果苏联军队继续占领该城市，那么阿塞拜疆将就退出苏联一事举行全民公决。
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