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人的思維各有不同，哪怕面對同一研究對象，每個人都有先見之明，會形成不同觀點，會產生多種方法。他又和周圍發生交流，不同觀點相互碰撞，不同方法相互借鑑，以帶來改進。這樣就會走向某種一致性，形成包括共同的信念、方向、方法、手段等在內的思想體系。
在古代，信息傳播效率不高，不同地域的人們缺乏交流，關於世界的認識相去甚遠，形成多元思想流派。醫學上更是這樣，人們關於疾病的看法各不相同，方法各異。近代以來，科學體系不斷完善，科學實證能力不斷加強，不符合實際的觀點消失了。信息交流愈發高效，在非生命的世界，科學幾乎已經統一。在生命的世界，在和人密切相關的領域，多元特徵明顯，觀點雖然不一致，方法雖然不相同，但都顯得正確，都能治病，讓人們有堅持的理由，因此形成多元醫學。
面對人類無法真正認識的對象，多種思路都會存在。想象古時候，人們對天或自然界的看法就有很多，認為自然是有神靈的，臆斷日食和月食的原因，斷定天災是君主犯下了過錯，把刮惡風歸咎於百姓怠慢了官差，等等。現在能明瞭其中的不妥，但在當時，我們決計無法明辨是非，多種認識就並存而無法消除。當下，科學能力有了提升，但在生命認識上還差得遠，不能避免此類困局。
一直以來，現代科學對自身的先進性全面性是滿意的，認為實驗室能研究岩石和細菌，也能正確認識生命和疾病。這種自信並沒有得到實踐的證明，人們還不能有這樣的警醒：在生命這種全向對象面前，單一的科學模式都不可能完全勝任，只要處於同一科學體系，所有人的思維就會體現某種特性，擅長某些方面，隔膜於某些方面。這就在客觀上導致多元醫學的存在。
科學並非純粹客觀的活動，科學並非絕對真理的描述，科學反應那個主體希望看到的世界，用什麼樣的思路研究世界，都會收穫相應的結論。一根手杖，自植物學者看去，是一束纖維質及細胞膜，化學家認為是複雜分子的集體，物理學家則認為是核和電子的集合體……這些觀點都能通過科學實證，因而都是科學的。這一結論在醫學上尤其成立，面對同樣的生命，西醫看到DNA雙螺旋結構和白細胞計數，中國人則看到元氣和陰陽，中西醫學在迥異地看待生命，都可能有效。科學依靠實證以避免危險，在複雜的生命面前，這準則並不能導向唯一的認識。
科學要反應研究者的工具看到的世界，他的認識決定了他所發展的工具，他反過來又會受到相應工具的影響，如此不斷，這樣相互促進的循環中，絕對指標並不存在，偶然性因素會導致大的分歧。比如，質地的堅硬和顏色的潔白都是石頭的屬性，想象我們分別給研究者以硬度計和色譜儀，他必定會報告相應的科學認識，並能不斷改進工具，形成自洽的體系。人類似乎能全面認識石頭，但對生命，中西方都不能全部認識，會發展多元工具，進而形成多元醫學。
有人會認為，這裡在偷換概念，硬度計和色譜儀都屬於一類工具，工具只有一類，所以醫學不應當多元。這是不對的，西醫的X光機是工具，中醫的望聞問切也是特殊的工具，工具是多元的，醫學也可以是多元的，並且，中醫工具也能迎接高科技的擴展，脈診儀已經面世，今後會有很多很多。
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