衛生院作為基層醫改的最大受益醫療機構，在政府辦醫的雄厚財政大力支持下，可謂在
近年來風光無限。但是“花無百日紅”，衛生院好景不長，在一系列制約衛生院發展的短板下，衛生院的日子將越來越不好過，假以時日不採取有效舉措，若干年後的衛生院，將重回二十年前或轉讓、或聯營、或倒閉的老路。
鄉鎮街道上
最好的大樓就是衛生院
近些年，假如你到了那個陌生的鄉鎮街道去找衛生院，根本不要問路，只要看到街道上蓋得最新、最好甚至最高的大樓就是衛生院。
一座座拔地而起的高樓大廈，鶴立雞群地坐落在破敗而又陳舊與雜亂的鄉鎮街道上，高、大、上的衛生院門前顯眼處，掛著多塊氣派的牌子。
有的藉著醫共體內省城醫院、縣級醫院的名頭擺噱頭，掛著XX省城醫院、縣級醫院的分院，外行人一看，當是在窮鄉僻壤碰上了三甲醫院；
內行人瞅瞅，只是苦笑了一聲是衛生院。衛生院雖小
但是大小領導一大把
一座衛生院內，多的職工有二百多人，少的員工也得四、五十個，而所謂麻雀雖小也得五臟俱全，故院長配置也得一正四副五個人，所以院長辦公室就佔據了一幢大樓的一層；而底下的科長也更不少，各個科室基本可以均分一位。
公衛的各條戰線上專人負專責，如婦保、兒保、慢病、健康教育、重型精神病、傳染病、健康體檢、計劃免疫等等又是一大班人！可見小小衛生院內機構氾濫，而導致人浮於事，有作為的醫生根本綁不住，而剩下的都是領著財政供養混著日子！
氣派的外表下
缺失擺上檯面的專科專長
由於鄉村醫療一體化後，政策在扶持衛生院中可謂煞費苦心，凡挨著衛生院近的衛生室都被一刀切地撤銷，致使衛生院在當地的硬件與軟件配置上一支獨大，理應在業務上發揮優勢，熟練接診基層常見病與多發病的基礎上，展開專科專長特色，以保持地域優勢而達到做大做強的目的。
但是，衛生院由於體制制約，在發揮醫生的激勵機制方面差強人意。雖然在近年來衛生院也在力推薪酬與績效掛鉤，但是基本上幹多幹少拉不開距離。甚至有位在臨床外科一線工作了二十餘年的執業醫師吐槽，他領的工資與整天抱著暖水袋的護士不差上下！
故衛生院的有幹勁的醫生基本上出走了，而抱著得過且過心態的醫生，對於如何提升醫療專項技術，突出專科特長方面缺失主觀能動性，致使政府出巨資扶持的衛生院只成為基層充當刷刷慢病藥的角色！
醫保扣費重
衛生院處於兩難尷尬中
醫保包乾制是醫保辦為了遏制近年來醫院內部的騙保、套保及揮霍醫保資金的不法行為。而包乾制又成為制約衛生院發展的瓶頸。
如有家蠻有實力的衛生院一年下來做了幾千萬元業務，但是超支醫保資金二百多萬元，就被扣沒了。
有衛生院職工四十餘人，一年下來做了六百多萬醫療業務，但是超過醫保核定六十餘萬元，就被強制扣沒了。
可見醫保包乾模式對於醫保基金的量入為出及用好醫保的每一分錢是意義重大。但是超額就扣沒的做法，打擊了衛生院做強做大的動力，明顯制約了衛生院的發展及壯大。
地方財政壓力大
對基層醫療投入逐年減少
由於近年來地方政府的財政壓力，故對於基層醫療的投入呈逐年減少趨勢，如近年來對於基藥補助也是呈現了驟降。這使基層醫療機構在加薪無望的前提下又減少了，而衛生院本身又缺乏利潤來源的前提下，促使了有能力的醫生只有跳槽與出走。
衛生院最大收入
面臨著越來越多的質疑
當下維持衛生院正常運轉的最大經費來源就是逐年上漲的公衛人頭費，衛生院作為與鄉村醫生共同承擔政府購買服務的公衛項目，向來由衛生院考核下，分配給鄉村醫生。從全國大部分村醫的訴求中，可見公衛經費是本糊塗賬。
而由於各地鄉村醫生對於公正分配公衛經費的願望隨著時間的推移愈發強烈，這也引起了社會各界有識人士的質疑與呼聲，故公衛經費成就了衛生院一家獨大的局面將會打破，
而衛生院也將在缺失了鉅額公衛經費補助的情況下，日子更加難過。寫在最後
可見衛生院在地方財政投入逐漸減少，自身專項技術沒有發展優勢，醫保包乾制一刀切，公衛經費將步入公開分配等等……那麼衛生院在收入驟降而又業務收入增加乏力的前提下，將面臨著巧婦難為無米之炊。故如不採取有效措施，若干年後，大批衛生院將走上或轉讓、或改制、或倒閉的資產重組之路！
