《黃帝內經》雲“夫自古通天者，生之本本於陰陽”，又云“陰陽者，天地之道也，萬物之綱紀、變化之父母，生殺之本始，神明之府也，治病必求於本也”。意思是說：陰陽是天地一切事物的綱領，是事物運動變化的根源。當人體出現疾病傷痛，要從陰陽這個根本上確定原因。中醫學理論八綱辯證中認為，陰與陽兩綱是八綱之總綱。一切病症，均可歸納為陰陽兩大類，即預測人體疾病就要從陰陽,也就是內外、上下、表裡辯證分析，查找原因。
根據易學象、數、理的摹擬性，採用比類取象的方法，奇門遁甲以九宮八卦摹擬人體。
內外盤分別代表體內和體表，內盤為體內，代表臟腑、血液、神經、內分泌等等。外盤則為體表四肢、頭、頸、肩、背、胸、腹等部位。
九宮代表的人體部位
離宮、巽宮、坤宮代表上部，包括頭、肩、雙耳；震、兌，中五宮代表中部，包括胸、背、腰、腹、肋部位，艮宮、坎宮、乾宮為下部包括左右、腿、腳、生殖器官、腹部。
依據八卦五行屬性，奇門內外盤的結合，以離宮代表頭部、眼睛、面部。離為火，主心臟血液、心腦血管，坤宮代表上右側肢體。坤為土為肌膚、脾胃食道、胰臟等消化系統，
巽宮代表左上側肢體，為耳朵、頭髮、肩。巽為風主傷風、中風、經絡、氣血，巽為木為膽，
震宮代表左肋、腰，震主動為腳足，震為木主肝，
兌宮代表右肋腰、胸部位，兌為金主肺、口舌、牙齒，體內為肺、氣管。
艮為體表，代表左腿，艮為山在面部又為鼻子，艮為土又為腸胃消化系統結腸部位，
乾宮在體表為右腿，乾為天為首，代表頭部，乾為金主胸、肺、脊髓、筋骨、大腸。
坎宮體表為腹部、生殖器，坎為水，在體內為膀胱、腎臟、內分泌系統。
十天干代表的人體部位
1、甲膽乙肝丙小腸 ，丁心戊胃己脾鄉。庚是大腸辛是肺，壬是膀胱癸腎藏。
2、甲頭乙肩丙為額，丁齒戊鼻己為面。庚筋辛肋壬為脛，癸為雙足是真蹤。
3、甲頭乙項丙為肩，丁胸戊肚己為腹。庚為腰間辛為肋，壬為腹部癸四肢。
總的來說甲為首為頭部（包括六甲值符）甲為木，為肝膽，同時六甲值符又各主其事，如甲子戊、甲戌己則主脾胃，甲申庚則為腸筋骨、腫塊等，乙主肝膽、食道、脖項，乙的形象又代表神經、背部，乙為日奇居東方震宮，乙為花草之木故又代表中醫、中藥（因中藥多為草木），依據乙奇落宮狀態又有不同的判斷思路，
如乙在離宮、巽宮一般為脖子、食道、頸椎，巽宮又多為肝膽部位。乙在震宮多主肝膽、足部，乙在坤宮又代表食道，乾宮又為脖子、頸椎，在坎宮又為男性生殖器，女性輸卵管、陰道，也代表肝膽等。
丙在體表主額頭、肩、背、嘴唇（因人體嘴唇紅色）體內則為小腸，丙為太陽之火，主燒傷、燙傷、血光腫脹，測病多主病灶部位發炎紅腫、血絲、傷口有血之象，如丙落離宮多主頭部腫脹、眼睛有血絲，坎宮則主陰道、子宮發炎等現象發生，但一定要綜合考慮。
丁為火主心臟、眼睛、牙齒，丁為陰火、星火也主炎症，但較丙火輕微一些。依形象而言，丁為手術刀、針灸，測病遇丁多主開刀手術治療之象，或扎針灸，測病老年人多主心臟，特別落離、兌、乾宮，青年人則主眼睛、心臟，其它宮位多指病灶發炎，
戊在體表則為肌膚，皮膚病、鼻子、肚子，體內則主腸胃消化系統，戊為土主增生之象。例如，戊在離宮多主頭部循環系統包括神經（臨癸、騰 蛇 ）受阻出現腦血栓、偏癱，臨坎宮則主子宮肌肉增生，輸卵管或尿道、陰道受阻，前列腺肥大，落中宮、震兌宮多主腸胃、腰椎增生、後背痠痛，臨乾艮多主左右大腿、靜脈曲張、壓迫血液循環神經系統造成麻木、痠痛，左側結腸等問題，婦女測病臨壬，癸落中宮、兌宮、坎宮多主性生殖功能疾病，如輸卵管堵塞造成不孕症。
己為面部，如臨壬癸多主濃瘡、粉刺，臨離宮多主頭上有濃瘡、長疙瘩，在體內則主脾臟的問題，體表也代表口腔，
庚為大腸、筋骨，奇門遁甲中庚為阻隔之神，代表腫塊，如庚臨壬，癸落離宮多主血栓、腦瘤、血脂瘤，臨坎宮多主腹部腫脹子宮肌瘤，庚臨死門、傷門主癌症，如庚臨死、傷落，乾離二宮多主腦癌、骨癌、血癌（臨壬癸）臨震巽多主肝癌，臨艮宮則主結腸癌，坤宮則主食道癌，兌宮多主肺或支氣管癌，中宮或兌宮又主腰椎增生，巽宮又主淋巴腫塊或癌、脖子腫塊，辛主肺部、支氣管、腹部，
辛為金為骨骼，如辛在兌、乾、離宮多主支氣管肺部的疾病，臨中宮則主腰椎，臨戊己多為骨刺或脊椎增生，臨丙、丁多主肺炎、支氣管發炎、肺結核等病，受傷部位則主胸、腹部。
壬為水主血液，主動脈、心臟、膀胱、泌尿系統又為眼睛、頭髮、腋下（因水主黑色）如壬臨離宮多為心腦之疾，乾宮多為腿腦頭部，坎宮則為生殖泌尿之疾，震、巽多為肝膽心臟、腿腳，特別壬落巽宮為六儀擊刑必有腿腳之傷，看乾艮二宮那宮臨傷門，白虎或景門兇格則必傷那條腿。特別男性、青年人，壬臨坎宮則主糖尿病、膀胱、腎功能的問題，臨坤宮則為食道、耳朵、脖子。
癸為水主腎、泌尿、輸卵管、尿道、靜脈、神經系統、足部、四肢、循環系統、中樞神經、性病，如臨坎、兌宮多主生殖泌尿之疾，臨離宮多主神經、腦血管，臨巽宮則主腿腳傷災（六儀擊刑），坤宮主皮膚病。
八門
八門的落宮狀態也是預測疾病時的重要參考因素。
開門主積極治療宜到醫院、外面去治不宜在家中，開門主開刀做手術治療，開門為金落艮宮入墓則開刀治療不理想。落乾兌吉，離宮兇，開門為病又代表肺癰、喉舌休門則主休息、靜養，不宜四處跑動求醫問藥，
休門為病則主瀉痢傷寒。
生門主癒合較好，治療有望，有生機，不會死去，起死回生之意。生門為病則主癰毒、傷目。
傷門主傷災、受傷部位，腫塊、抽風、寒症、傷災造成，比較難治，傷心過度。
杜門主阻隔、難度，治療難度大，不順利，堵塞之症。
景門則為血光之災，受傷流血，心腦血管疾病，血壓頭暈等症。
死門主大凶，死亡，無藥可救，治療灰心，傷疤（死去的部位）、屍體腐爛的組織，肌肉壞死的部位。
驚門主心驚肉跳、心慌心律不齊，脈膊跳動不穩、失眠，多做惡夢驚醒，癆病，擔心不能治療等情況，大多反映病人心理狀況。
八神
八神的落宮也能反映疾病的各種信息，例如：
病神臨值符多得名醫名院貴人、長輩、領導從中救治幫助，治療環境好，醫療護理均為一流高檔次的。
騰蛇主驚恐，病情變化不定時好時壞，疾病繞身，夜裡多夢，遺精、中樞神經有問題，神經意識模糊。
太陰代表肺症、骨虛、無力之象，提不起精神，軟弱無力等。
六合主綜合症，多種病，擴散部位，麻瘋症，多種疾病纏身，病變等。
白虎主傷病很重，主遭意外傷害，白虎亦代表受傷部位，如日時年命病神落宮乘白虎大多發生傷災疾病或親人去逝之事。如臨傷門馬星則主車禍引起，景門則主刀光血影或道路上發生，臨開門則可能發生在工廠、企業、門面店鋪之中，臨死門則主身體易留下了傷疤或受災之時又死了人。白虎落宮可能是受傷部位，例如白虎臨乾宮可能頭部受傷或腳上受傷，又可能為父親去逝而戴孝。
玄武主暗疾，診斷不明卻疾病困擾，病因不詳，玄武代表頭暈、昏迷、血液病，玄武又代表怪異之物作怪。玄武又代表嘔吐，傷或死於路上。
九地為陰症，表示病情穩定，不擴散發展，但又有入地死亡之象，血壓偏低、不精神、昏沉之象。
九天則主陽症，血壓高，昇天之象，病灶在上部，九天為失魂落魄，從高處摔傷之象。
格局組合
格局的克應變化，天地盤上下相加也反映病情病因。如：
天芮病神臨乙十辛，龍逃走，丙十庚賊必去，雖為兇格，但要相對分析，說明病神即將離去。
而臨辛十乙虎猖狂，丙十戊、鳥跌穴，戊十丙龍返首雖臨吉格則好比人入墳墓之象，預示即將死去。
辛十乙虎猖狂，癸十丁，蛇天矯，辛十庚白虎出力，丙十癸，陰人害事，庚十丙賊必來，則說明病情將加重。
戊十丁，青龍轉光，丁十丙，星隨月轉，辛十丁獄神得奇則預示病情即將好轉。
戊十庚、庚十戊則疾病要擴散，需換醫院醫治，
戊十壬青龍入天牢，乙十己日奇入墓，乙十壬，日奇入地，丁十辛朱雀入獄，己十己地戶逢鬼，己十辛遊魂入墓，己十壬地網高張，己十癸地刑玄武，辛十戊困龍被傷，辛十癸天牢華蓋，壬十辛騰蛇相纏，壬十壬蛇入地羅，癸十庚太白入網，癸十辛網蓋天牢則主疾病纏綿不去，病情加重，久病不愈之象。而己十辛，己十己則預示舊病不去，新病又來，
乙十丙奇儀順遂，乙十丁奇儀相佐，丙十乙日月並行，丁十丁星奇入太陰，庚十乙，太白逢星，壬十乙小蛇得勢則說明病情向良好方向發展，
己十戊，犬遇青龍，壬十戊，小蛇化龍，辛十丁獄神得奇則有人幫助，得遇名師良藥之象。
大格、小格均為病情不穩定。地遁其人必死，鬼遁五假人遁也非吉兆，三詐病情反覆不定，玉女守門，久病不會治癒，三奇得使對病情有利，特別是丁奇、日奇為解救神，
朱雀投江丁十癸必死。癸十丁蛇天矯，易見鬼怪之象，伏幹、飛幹診斷不明而藥不對症。飛宮、伏宮病人不安，家人驚恐，大格小格、胸悶而大小便不暢 。
刑格、悖格則肢體絡相傷害，但年月日時臨悖格則新舊病可治。
五不遇時人將逝，六儀擊刑主大凶。特別是甲辰壬臨巽四宮，甲寅癸臨巽四宮必有傷殘肢體腳、腿之災。甲申庚臨艮八宮則多主車禍、傷災，甲子戊臨震宮、甲午辛臨離宮、甲戌己臨坤宮一般主病痛之災。
三刑如甲申庚十甲寅癸臨巽宮，一般均主傷災病痛。天網四張，網蓋天牢，太白入網則主病難走，人臨危。
新病逢空者生，久病逢空者死，
新病反吟則生，久病反吟則死，
另反吟又代表急性病，病情反覆。
伏吟則為久病，慢性病，得病時間較長，短時期難以治癒。
用神
九星之中專以天芮星為測病之用神，看天芮星落宮結合本宮星門奇儀，內外格局判斷各種病情病狀，例如天芮為土宿，落離艮坤為得助則病情嚴重，落3、4宮則不藥而癒，落坎宮則久病纏綿，但月令對病情發展，病人狀態也極為重要，例如，辰月測病天芮病神臨3、4宮，雖入宮受制但辰月土旺木衰，則病星懲兇，或日干年命臨宮入死墓之地，又月令處死絕為死期或大凶不祥，月令也可做為應期。
另外，時幹也代表病情病因，古歌雲：“月幹為人時幹病，納幹之藏醫藥證，人克病兮可去瘥，病克人兮憂險應，醫能克病始可投，病若傷人未可用。是說時幹為病，日干為人；人克病則有望好轉，病克人則兇險加重。
天心星，乙奇為醫生醫藥，天心星為西醫藥，乙奇為中醫藥，如天心乙奇臨開、體、生三吉門主藥到病除之象。臨死、驚、傷、杜則主醫藥均不理想，臨值符則為高級藥品，名醫名院，值使同理。臨騰蛇或玄武則多虛假不實，假醫假藥，騰蛇死門也主巫婆、神漢、仙姑之類，玄武多主假醫假藥，欺詐上當受騙。天心、乙奇臨杜門，白虎則主醫術一流，技術過硬。臨太陰則主醫生心理細膩，心細認真，臨開門，丁奇則主手術開刀治療。但不論庸醫、良藥，但能克病星所落之宮，醫必有功。假如病星克天心星，乙奇所落宮位，雖名醫良藥，也不能治也。
附《奇門遁甲》佔病古歌：
懸系一法少人知，問人年甲病先知
男從坎上順數起，女向離宮逆點推
數到病人年甲上，看他因病預先知
子午卯酉定是死，寅申巳亥不開眉
辰戌醜末恐霍亂，此是神仙病應機
震巽相適手足麻，口中惡氣眼生花
神天保願來相助，若不相投氣喘加
坤艮脾傷胸不開，心中結定滯凝懷
腹臍疼痛連腰腿，陰邪見怪有飛災
乾兌多頭痛，沉沉六脈微
冷積並冷氣，其病在胸脾
坎離多嘔逆，久治號難醫
人虛常盜汗，飲食漸消除
總之測病時一定要多角度、多方面綜合分析，充分採用象數理中的比類取象，思外揣內，由此及彼，內外相應的方法和原則，如測病時除選用神天芮落宮狀態分析外，還要看日時落宮的星門奇儀，上下盤格局變化，旺相休囚狀態，同時兼看本人年命，所在方向等因素，例如測父母，除看天芮落宮外，同時兼看年幹、時幹、乾坤二宮、父母年命宮、父母所在方位等，測兄弟姐妹、親朋好友則要兼看月幹、時幹，測小弟還要兼看艮宮，則大姐則兼看巽宮，測小輩及兒女則要兼看時乾等等，總之要靈活取用，才能一箭中的。
關於定應期的問題也要視情況而定，如測本人則要看日干及年命的狀態，先看其旺相休囚，是否逢空，逢空者衝實填實為應期，六儀擊刑逢衝者則以合為應期，入墓者出墓衝墓為應期，臨馬星者逢馬星或衝動馬星為應期，病星落內盤主近期為應，外盤則久遠，遠則斷他年月，近斷日時，反吟則合為應期，伏吟則衝為應期，以值使門斷期限，例如值使臨生門落兌宮主2.7之數，遠斷則7個月，200天，近斷則2個月70天之內為應期，根據日干宮年命宮及用神所落位置綜合評斷應期。
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