SARS-CoV2能够感染巨噬细胞、猫及其起源和演化路程等


撰文 | 唐小糖


  • 【SARS-CoV-2可以感染CD169+巨噬细胞】


2020年3月31日,第三军医大学吴玉章团队在medRxiv上上传了一篇研究,通过解剖对6例脾脏(SP)和淋巴结(LN)的检测,发现SARS-CoV-2可直接感染二级淋巴器官,导致细胞死亡。免疫组化表明明ACE2在SP和 LN的组织常驻CD169+巨噬细胞上表达,免疫荧光染色证实N蛋白可在ACE2+细胞、CD169+巨噬细胞中发现,但不能在CD3+T细胞或B220+B细胞中发现。此外,SARS-CoV-2感染可引起严重的组织损伤,包括淋巴滤泡耗竭、脾脏结节萎缩、组织细胞增生和淋巴细胞减少。原位TUNEL染色表明,病毒感染导致严重的淋巴细胞凋亡,这可能是由病毒抗原诱导Fas加强调节介导的。此外,SARS-CoV-2还触发巨噬细胞产生IL-6,意味着可能存在ADE现象,这些结果表明,SARS-CoV-2通过感染组织-驻留CD169+巨噬细胞直接影响人类脾脏和淋巴结。

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原文链接:https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.27.20045427v1


  • 【SARS-CoV-2可以感染猫并通过飞沫传播】


2020年3月31日,中国农业科学院哈尔滨兽医研究所陈化兰步志高团队在bioRxiv上上传了一篇研究,研究了几种动物对SARS-CoV-2的易感性,结果表明在狗、猪、鸡和鸭子中病毒复制很差,但在雪貂和猫身上却能够有效复制。此外病毒在猫身上还可以通过飞沫进行传播。该研究为SARS-CoV-2的动物库及动物管理提供了重要的见解。

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原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.30.015347v1


  • 【SARS-CoV-2的起源及演化路程】


2020年3月31日,爱丁堡大学AndrewRambaut、格拉斯哥大学病毒研究中心DavidL Robertson联合宾夕法尼亚州立大学等多个团队,在bioRxiv上传了一篇研究,利用遗传学方法建模,根据HcoV-OC43和MERS-CoV的进化速率分析了SARS-CoV-2的进化路程,结果显示,SARS-CoV-2与蝙蝠冠状病毒之间的进化存在三个分歧点,分别在约1948年、1969年和1982年。SARS-CoV-2可能在蝙蝠中传播数十年后又传染给其他宿主如穿山甲,这是17年间发生的第三次冠状病毒爆发,再加上蝙蝠作为宿主的病毒多样性,很可能还会有其他病毒跨越物种界限,需要引起重视。

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原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.30.015008v1


  • 【SARS-CoV-2 S蛋白的特异性糖基化位点识别】


2020年3月29日,四川大学华西医院在bioRxiv上上传了一篇研究,使用阶梯式碰撞能量(SCE)质谱(MS)对SARS-CoV-2S蛋白的位点特异性N-糖基化进行特征分析。在用两种相互补充的蛋白酶消化后,分析了SARS-CoV-2S蛋白的N-糖基化图谱,覆盖完整的N-糖蛋白和糖基化位点,以及组分和位点特异性糖的数量。所有22种潜在的N-糖基化位点均在S蛋白中鉴定。其中有18种N-糖位在SARS-CoV和SARS-CoV-2S蛋白之间保守存在。在公共数据库中的753个SARS-CoV-2基因组序列中,几乎所有糖基化位点都保存了下来。相比之下,昆虫细胞表达的SARS-CoV-2S蛋白含有38种N-糖,主要是N-甘露糖。而人类细胞表达的蛋白质含有多达140种N-糖,主要属于复合型。特别注意的是,S蛋白受体结合域中的两个N-糖基化位点在人类细胞中表现出相对保守的成分。该研究对糖基化位点的分析和确定不同表达系统之间的差异对揭示感染机制有重要提示作用,同时也促进了疫苗和靶向药物的研发。

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原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.28.013276v1


  • 【SARS-CoV-2的位点特异性糖基化分析】


糖基化修饰可以遮蔽抗原,帮助抑制免疫原性和进行免疫逃避,识别糖基化对病毒病理学和疫苗设计具有深远影响。

糖基化位点的数量,埃博拉病毒有8-15个,流感病毒有5-11个,丙肝病毒有4-11个,HIV有20-30个,而SARS-CoV-2的S蛋白共有至少66个糖基化位点,这可能会给疫苗的研发带来困难。2020年3月28日,牛津大学在bioRxiv上上传了一篇研究,使用位点特异性的质谱方法,在重组SARS-CoV-2S蛋白免疫原上揭示糖基化结构。该分析能够映射到整个病毒S蛋白的糖蛋白状态。结果展示了SARS-CoV-2S蛋白糖基化的特征,该研究组之前也上传过SARS-CoV和MERS-CoV的糖基化分析。


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原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.26.010322v1


  • 【来自骆驼的单域抗体对β冠状病毒有潜在的中和作用】


2020年3月28日,德州大学奥斯汀分校JasonS McLellan团队在bioRxiv上上传了一篇研究,描述了单域抗体(VHHs)的分离和鉴定,VHHs来自于预融合稳定的S蛋白免疫的骆驼。这些VHHs能够有效中和MERS-CoV或SARS-CoVS假病毒。这些VHHs与各自的病毒靶点结合的晶体结构揭示了两个不同的表位,但两个VHHs都封阻了受体结合。作者还展示了SARS-CoVS的VHH和SARS-CoV-2S之间的交叉反应,并证明这种交叉反应有能力中和SARS-CoV-2S假病毒作为人类IgGFc融合。这些数据为VHHS中和致病性β冠状病毒提供了分子基础,并表明这些分子在冠状病毒爆发期间可能被用于作为有效的治疗药物。

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原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.26.010165v1


  • 【SARS-CoV-2的N蛋白破坏诱导多能干细胞(iPSC)的多能性】


2020年3月28日bioRxiv上传的一篇研究通过慢病毒表达系统生成了iPSC过表达SARS-CoV-2的N蛋白(iPSC-nCoVN)。在nCoVN表达两周后,iPSC的形态和增殖率发生了变化。多能标记SSEA4和TRA-1-81在iPSC-nCoVN中无法检测到。同时,iPSC-nCoVN在使用常规分化方法时失去了分化成心肌细胞的能力。该数据表明,nCoVN会破坏iPSC的多能特性,并将其转化为成纤维细胞,这为SARS-CoV-2的致病机制提供了新的见解。

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原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.26.010694v1


  • 【靶向SARS-CoV-2的Mpro的潜在药物研究】


2020年3月28日,上海药物研究所、上海科技大学等多家机构在bioRxiv上传了一篇研究,设计和合成了两种针对SARS-CoV-2的Mpro的化合物(11a和11b),两种化合物均表现出优异的抑制活性,IC50值分别为0.05μM和0.04μM。值得注意的是,这两种化合物在细胞上均表现出有效的抗SARS-CoV-2感染活性,EC50值分别为0.42μM和0.33μM。SARS-CoV-2Mpro 在11a和11b的复合体中的X射线晶体结构分别以1.5A的分辨率识别。晶体结构表明,11a和11b与Mpro的Cys145不可逆共价结合。这两种化合物都是有希望的药物,具有临床潜力,值得进一步研究。

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原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.25.996348v1


  • 【脂蛋白核苷酸融合抑制剂抑制SARS-CoV-2膜融合】


2020年3月28日,中国医学科学院在bioRxiv上传了一篇研究,首先验证了SARS-CoV-2使用人类ACE2作为细胞受体,及其S蛋白的膜融合活性。与SARS-CoV相比,SARS-CoV-2的S2融合蛋白中的二次HR1序列具有显著的稳定性,并且与其相应的HR1位点具有更高的结合亲和力。然后,作者设计了一种基于HR2序列的脂蛋白核苷酸融合抑制剂,称为IPB02,在SARS-CoV-2S蛋白介导细胞-细胞融合和假病毒感染中表现出很高的活性。IPB02还有效地抑制了SARS-CoV假病毒活性。该研究结果为了解SARS-CoV-2的进入途径和针对膜融合步骤的抗病毒药物设计提供了重要信息。

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原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.26.009233v1


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