大棚番茄在种植时应选择抗病品种，注意轮作换茬，稀植。定植时地面覆盖地膜，合理施肥浇水，适时通风降湿。挂果期在晴天上午浇水，阴天或傍晚不宜浇水，避免湿度过大诱发病害。及时摘除果面残留枯花瓣与病果及下部的病叶，并带出田外集中深埋。
不然进入开花挂果期，随着追肥、浇水次数的增加，容易发生早疫病、叶霉病、灰霉病。而番茄枯萎病，是通过带菌的土壤和流水传播蔓延，它发生的适宜温度是28℃，土壤湿度越大，发病越严重。
如何防治这些病害呢？
枯萎病：
应与葱蒜类蔬菜实行3至4年的轮作；防止幼苗染病，即育苗的苗床要采用新土或者进行苗床消毒；播种前应进行种子消毒，可使用0.10%硫酸铜溶液浸种5分钟，洗净后催芽播种；发病后要及时拔除病株并喷药保护；在幼苗期后至发病初期，进行药剂灌根。可用70%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液、50%多菌灵可湿性粉剂600倍液等，每株用药100毫升，间隔10天灌一次，连灌3至4次。
早疫病：
用70%甲基托布津800倍液、75%百菌清600倍液、70%代森锰锌500倍液、77%可杀得500倍液，交替喷雾；阴雨天气不宜喷雾，改用45%百菌清烟剂熏蒸，每667平方米用药250g。番茄上市前10天停止施药，避免果实污染。
灰霉病：
采取激素沾花带药预防，即番茄第1花穗50%开花后，气温低于20℃时，用毛笔蘸50ml/L防落素液（或15～20ml/L2，4-D）和0.1%速克灵混合液涂花柄；气温20～30℃用30ml/L防落素液和0.1%速克灵混合液喷花；气温高于30℃用10ml/L防落素和0.1%速克灵液喷花。随着气温升高，防落素浓度要逐步下降，喷花时不能碰到生长点，以防药害。发病初期用50%速克灵（或扑海因）1000倍液、40%施佳乐600～800倍液、65%甲霉灵600倍液，交替喷雾花和幼果，每7天1次，连喷2～3次。
叶霉病：
用40%杜邦福星5000倍液或47%加瑞农800倍液交替喷雾，每7天喷1次，连喷3～5次。
