目前，新冠病毒已致我國數萬人感染，上千人喪生，並蔓延至全球20多個國家。確認中間宿主對阻止病毒的進一步傳播至關重要。
此前，研究人員先後提出蝙蝠或是新冠病毒自然宿主，蛇、穿山甲可能是潛在中間宿主。
2月26日，湖北醫藥學院附屬人民醫院的劉龍聯合廣州暨南大學吳建國課題組在《醫學病毒學雜誌》上發表論文稱，龜類（西部錦龜、綠海龜、中華鱉）也可能是將新冠病毒傳播給人類的潛在中間宿主。
最新研究採用冠狀病毒刺突蛋白和宿主ACE2受體的組成和差異，預測SARS-CoV-2的潛在中間宿主。
該研究的重點是比較SARS CoV-2與SARS-CoV、蝙蝠SARS樣CoV和其他冠狀病毒之間的刺突序列。這有助於進行進化分析，並尋找可能的病毒庫。此外，對ACE2結構和結合基序比對的分析，有助於提供線索來區分潛在宿主。
SARS-CoV-2編碼至少27種蛋白質，包括15種非結構蛋白、4種結構蛋白和8種輔助蛋白。刺突蛋白（S）是一種結構蛋白，位於病毒體的外殼上，負責與宿主受體血管緊張素轉換酶2（ACE2）結合。研究刺突蛋白中受體結合區域（RBD）序列的進化關係有助於理解病毒起源趨勢。
研究結果表明，蝙蝠SARS樣CoV RaTG13與SARS-CoV-2整體基因組具有96.2%的序列同一性。值得注意的是，SARS-CoV是穿山甲標本中分佈最廣的冠狀病毒。
刺突RBD受體相互作用是決定冠狀病毒宿主範圍的關鍵因素。研究組對來自SARS-CoV、蝙蝠或穿山甲SARS樣CoV和SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD序列進行了比對。
蝙蝠SARS樣CoV從第473到第490個殘基缺失，位於外部亞結構域，似乎可以確定這些病毒不會自然感染人。目前並沒有直接證據表明，蝙蝠SARS樣CoV曾感染人類。
穿山甲SARS樣CoV SRR10168377與蝙蝠SARS樣CoV RaTG13僅具有85%的同一性。這表明如果只關注刺突RBD，穿山甲SARS樣CoV SRR10168377有可能越過宿主屏障感染人類。
類似SARS-CoV與人ACE2的結合，受體上的31、41、82、353、355和357位殘基在與SARS CoV-2刺突蛋白相互作用時會定位到表面。
從具有ACE2受體41和353位的RBD域中的Asn501來看，龜類和穿山甲似乎比蝙蝠更接近人類。這表明龜類和穿山甲可能是SARS-CoV-2的潛在擴展宿主。
瞭解結構結合機制將有助於找到準確的病毒庫，並有助於制定預防對策。通過冷凍電子顯微鏡緊急分析SARS-CoV-2刺突蛋白的結晶體，有助於驗證SARS CoV-2刺突RBD與人類ACE2或其他宿主受體之間相互作用的結合點。
據報道，SARS-CoV-2 刺突蛋白與ACE2的結合能力比SARS-CoV強得多。這表明SARS-CoV-2的中間宿主更多。
目前已知龜類作為病毒庫，攜帶數十種病毒，包括虹蛙病毒（RV）、尼多病毒（NV）、乳頭瘤病毒（PV）、甲魚虹彩病毒（STIV）、甲魚系統性敗血症球狀病毒（STSSSV）、龜細小核糖核酸病毒（ToPV）和中華鱉出血綜合徵病毒（TSHSV）。不能排除蝙蝠SARS樣CoV RaTG13或其他SARS樣CoV感染龜類，並在進化後向人傳播。
從SARS-CoV和MERS-CoV到SARS-CoV-2，蝙蝠均是冠狀病毒的天然宿主，但中間宿主卻各不相同。此前研究表明，與其他動物相比，蛇因其同義密碼子相對使用度（RSCU）偏向，很有可能是SARS-CoV-2的野生動物病毒庫。
果子狸和單峰駱駝作為人畜共患病SARS-CoV和MERS-CoV的中間宿主，生活在不同的時空環境，但它們仍將冠狀病毒傳播給人類。這使得短期內找到SARS-CoV-2的中間宿主很難。
病毒受體結合序列和宿主受體的分析有助於快速靶向SARS-CoV-2可能的中間宿主。與非法交易的穿山甲相比，市場上的龜類更普遍受歡迎。
總之，該研究提供了一些信息，即與蛇和穿山甲一樣，龜類（西部錦龜、綠海龜、中華鱉）亦可能是將SARS-CoV-2傳播給人類的潛在中間宿主，但仍需進一步研究來確認。
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1.蛇
1月22日，北京大學團隊發現新型冠狀病毒與蛇具有相似的密碼子使用偏倚，推斷蛇可能是潛在中間宿主。
2.蝙蝠
2月3日，中科院武漢病毒所石正麗團隊在Nature發表的論文顯示，中華菊頭蝠最有可能是新冠病毒的自然宿主。
3.穿山甲
2月6日，華南農業大學團隊研究表明，穿山甲為新型冠狀病毒潛在中間宿主。
2月20日，香港大學公共衛生學院教授管軼在穿山甲樣本中發現了冠狀病毒，再次表明穿山甲應被視為新型冠狀病毒的可能中間宿主。
相關論文信息：
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/jmv.25726
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