土壤與人一樣，要想保持健康狀態，也需要良好的呼吸，即土壤中的氣體交換。一旦氣體交換受阻，雖然看不出土壤有什麼變化，但是依賴土壤生存的植物、有益微生物、有益動物都會受到嚴重影響。土壤喘不動氣了，植物根系不能呼吸，葉片表現黃化；在厭氧狀態下有益微生物活動緩慢，分解產生較多的有害物質；有益動物（例如蚯蚓等）大量減少。北京金寶貝微生物菌肥專家看到許多客戶的種植做法都會影響土壤氣體的交換，怎麼樣來改善這些不恰當的管理方式，是需要客戶們認真考慮到以下幾個問題。
1、翻地過於精細
在定植之前進行翻地施肥，可打破犁底層，疏鬆土壤。而隨著機械化程度提高，不少客戶過度依賴機械翻耕，並且有的客戶使用旋耕機翻耕多次，經過翻耕的土壤雖然看上去鬆軟，但由於把大量的多孔結構的構造打破，使大量細小顆粒分散在土壤中，澆水之後這些顆粒隨水沉積，更容易形成犁底層。而且由於一些較大的團粒結構被破壞，土壤的氣體交換能力變得更差，更加不利於根系的生長。
2、生土施肥過少
尤其是新建棚室，由於把結構好、肥力高的土壤用於築牆，用於栽培的土壤換成了生土，生土團粒結構極少，耕性差，繼續依靠增施有機肥來快速熟化土壤，以提高土壤的氣體交換能力。而如果新建棚室施肥量過少，特別是有機肥用量不足時，土壤結構得不到大的改善，氣體的交換能力自然也不強，所以新建棚室生土栽培蔬菜更容易出現根系生長不良引起的生理性問題。
3、不注重劃鋤
一些有機質含量少的棚室土壤，容易出現板結的情況，特別是用於澆水的種植行，當植株封壟以後，在光照弱、氮素高時，會在地表出現大量的青苔，青苔生長不僅需要氧氣，它們佈滿地面以後阻斷了土壤氣體的交換。而劃鋤就是打破板結，減少青苔產生，提高土壤氣體交換效果的重要措施。特別是對於比較黏重的土壤來說，勤劃鋤可以快速恢復植株長勢。
4、全地膜覆蓋
地膜全棚覆蓋是一個老話題，我們不提倡地膜全棚貼地覆蓋，就是因為它對土壤氣體交換影響巨大。在高溫季節，地膜全棚貼地覆蓋會造成土溫過高，加上透氣不良，嚴重影響作物根系生長，如8月份左右拱棚種植長茄，若採取這樣的覆蓋措施，多發生長勢弱、葉片黃的不良情況。在冬季低溫季節，全棚覆蓋地膜雖然有較好的保溫降溼效果，但根系生長需要的氧氣量不足，同時土壤微生物分解產生的二氧化碳也不能及時排到空氣中，大量的二氧化碳存在於土壤中，不僅根系生長受抑制，也造成了碳源的浪費。
5、犁底層高且澆水勤
土壤犁底層是由大量黏粒組成的不透水不透氣的一種對作物生長不利的土壤結構，在透水透氣的沙性土中我們希望有犁底層的存在，而在壤性及粘性的土壤中犁底層卻不利於根系生長。尤其是犁底層過高、過厚的情況下，菜農澆水過大、過頻，水分被犁底層阻擋以後不能及時排走，大量的氣體被水分擠出，從而影響到土壤中各種動植物、微生物的生存。
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