流感病毒入侵人体，需要突破呼吸道的防御屏障，比如打喷嚏、呼吸道粘膜分泌的粘液。一旦病毒接触到呼吸道细胞，就开始破坏这些上皮细胞产生空泡，细胞将快速坏死释放出病毒复制出的子代病毒，继续下一波传染过程。
这时候，呼吸道粘膜上保护细胞的粘液就变稀了。这就是为什么会流清鼻涕的原因。这时机体的免疫能力下降，而稀释的粘液进入呼吸道的深处，会引发更严重的感染。
这时，发烧和咳嗽比较普遍，这两种症状都不是病症，而是流感病毒感染的适应症。发烧是提高免疫细胞的活性，咳嗽是将病毒排出体外的机制。如果错误的用了抑制咳嗽的药，比如甘草类，咳嗽的肌肉被麻痹，咳嗽被止住。病毒也就不能被及时排出。因此，将导致感染的加重，甚至感染下行。
只有剧烈的咳嗽，影响到睡眠，或者剧烈到损伤喉咙，才开始考虑适度的抑制咳嗽。由于剧烈咳嗽往往伴随细菌混合感染，所以也需要同时服用抗生素，防止感染加剧。
所以，咳嗽的时候首先考虑的是为什么咳嗽，提醒自己咳嗽本身是一种防御机制，多饮水，及时将污染的分泌物清洗干净，使用保护粘膜的药物，而不是止咳。
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