本片涉及了大量中國歷史、醫史，收集了大量歷史故事和珍貴文物，從遠古，到伏羲、神農、黃帝，到夏商周秦漢唐宋元明清，使深奧的理論通俗化趣味化。
除了關照對中國傳統文化感興趣的觀眾外，影片還針對中醫愛好者、中醫學子，精心挑選了八十多個古代醫案，令本片更加妙趣橫生。同時，我們採訪了數十位當今中國第一流中醫專家，可令中醫從業人員大大獲益。
《黃帝內經》目錄：
1、神奇的秘笈
2、赫赫始祖（上）
3、赫赫始祖（下）
4、遙遠的生命呼喚
5、走出洪荒的歲月（上）
6、走出洪荒的歲月（下）
7、石破天驚
8、千秋聖典（上）
9、千秋聖典（中）
10、千秋聖典（下）
11、閒雲野鶴
12、仙風道骨（上）
13、仙風道骨（下）
14、妙手回春
15、杏林魂
16、靈丹妙藥
17、撩開氣的蓋頭（上）
18、撩開氣的蓋頭（下）
19、憂患的乾坤
20、大智者的玄思
21、陰陽流變
22、絕妙的辯證（上）
23、絕妙的辯證（中）
24、絕妙的辯證（下）
25、五行大法
26、天才的表述
27、五行循環天地人
28、五臟的奧秘（上）
29、五臟的奧秘（下）
30、情緒與生命（上）
31、情緒與生命（下）
32、神妙的經絡（上）
33、神妙的經絡（下）
34、陰晴圓缺
35、風調雨順
36、生存的空間
37、望聞問切
38、秋山紅葉
39、孤帆遠影
40、風雨瀟瀟說君王
41、仁者壽（上）
42、仁者壽（下）
43、但願人長久
44、生命水
45、萬世清香
46、對酒當歌
47、曲水流觴
48、不治已病未病
49、天若有情（上）
50、天若有情（下）
53、魂斷廣陵散
54、生命的強者
55、長壽之道
56、謹和五味
57、生存的空間（上）
58、生存的空間（下）
59、起居有常
60、蓬蓬遠春
《黃帝內經》僅代表當時醫學理論水平，它是以自然哲學的思維來解釋自然科學問題的理論假說，雖然發現了許多客觀的規律與結論，也有不少錯誤的猜測。《黃帝內經》中概念多，但定義少，需要辯證體會；書中有些概念的含義與現代不同，要區別對待。
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