經常鍛鍊不僅能控制身體脂肪數量，還有助於保持健康膽固醇水平。研究發現，社群壓力是導致肥胖和膽固醇水平不健康的原因之一。身體為了釋放壓力激素，會將其它部位的脂肪轉移到腹部，並因此而導致肥胖；而腹部肥胖會增加膽固醇過高和心臟病風險。因此，專家建議人們通過經常鍛鍊降低心理壓力的負面影響。
減少脂肪
跑步能減少身體脂肪數量，但並不是馬上減少，而是逐漸積累的結果。有報告說，跑步等有氧運動燃燒的熱量 65%-95% 是源自身體存儲的脂肪。具體的熱量燃燒比例取決於有氧條件和運動強度。
脂肪與肝糖
人體在跑步時會燃燒熱量獲得能量，跑的越努力，時間越長，需要的能量越多。然而，脂肪熱量供應的能量會隨著能量需求增加而降低。較長和較劇烈跑步期間會從存儲在體內的肝糖獲取更多熱量，而不是燃燒脂肪。肝糖是身體從碳水化合物存儲的能量。
促進新陳代謝
跑步等更劇烈心血管鍛鍊會在結束運動後提高新陳代謝率。這意味著身體在結束劇烈跑步後，會繼續燃燒源自脂肪的熱量。不太劇烈的心血管鍛鍊沒有這種擴展脂肪燃燒的好處。雖然強度較低的運動只從脂肪獲取能量，但專家建議通過高強度跑步消除更多脂肪，因為跑步前後的燃燒脂肪累積效果更好。
總膽固醇減少
與舉重或摔跤等靜態運動相比，越野跑等階段性運動減少血液總膽固醇水平的效果更好。階段性活動使用更多快速自適應動作，肌肉收縮週期短；而靜態運動需要的動作少，但肌肉收縮持續時間長。發表在美國脂質研究雜誌上的一篇報告說，試驗發現，階段性運動能降低膽固醇水平，但靜態運動不能。此外，高強度運動減少膽固醇數量的效果更好，因此更劇烈的跑步比強度低的跑步對膽固醇的積極影響更大。
高密度脂蛋白（HDL）增加
跑步還能促進提高血液中的高密度脂蛋白水平。HDL 是好膽固醇，因為它能通過將膽固醇轉移出動脈保護心臟。研究發現，跑步公里數多的女性血液中的高密度脂蛋白水平相對較高。每週跑步 40 公里，能提高女性高密度脂蛋白水平，並降低心臟病風險 30% 左右。另一方面，男性每週跑步，每增加 10 公里，能在提高好膽固醇水平的同時，降低心臟病發風險 10%。
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